所以李来亨依靠国初朝廷强大的威望和行政执行能力，直接用行政法令确立永佃权的合法性以及地租不得超过四成的严格规定。
这两项法令，在当时统称为“护佃新法”。其中强制要求地租不得超过四成的法令，在江宁、苏松、淮海、江西、浙江、福建这东南六省，直接造成了举省哗然的大骚动。
大量江南搢绅组织家仆，冲入府衙之中，殴打官差，烧毁法令，简直形同造反。
对此种情况，李来亨一面下令调动驻军，准备在形势彻底失控的时候直接采取断然的武力镇压。另一方面，他也命令地方的捕盗使、营田使、推官们，组织那些在“护佃新法”中获利的贫农和士绅进行抗争。
天法二年九月十一日，太仓搢绅以吴伟业为首，率领家仆二百多人围攻府衙，殴打官差，致使三名官差书办被活活打死，十余人受伤；
天法二年九月十八日，在太仓当地营田使的组织下，由无地贫农组织起来的常备民兵，以五百人兵力突然冲入太仓州州城，当地守军打开城门，坐视不管，致使民兵竟然将吴伟业为首的十一户士绅大家洗劫一空，并焚其豪舍而返。
以“太仓案”为导火索，苏松、江南、浙江、江西、福建、淮海六省，相继爆发了大量搢绅围攻府衙和民兵报复搢绅的暴力骚乱事件。
整场骚动持续了三个月之久，直到新年到来后才渐趋平定。
“太仓案”以及后续发生的大量相关案件，直接造成了上千人死亡和上万人受伤，波及六省，规模极为浩大。
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