坐镇中军的武田晴信无法继续坐视先阵的溃败而不管，随即下令马廻众与西方众前去接应先阵的溃兵，同时向死死咬住先阵溃兵而紧追不舍的小笠原军侧翼发起猛攻。武田军在经过半个时辰的奋战后，总算遏制了小笠原军的追击，从而得到了收拢先阵败军的时间。
小笠原长时此时也是见好就收，因为他深知眼下自己手中并没有太多的兵力供自己挥霍。故而在见武田军开始拼死抵抗之后便不再继续猛攻武田军了。
虽然暂时击退了武田军的来袭，但是和村上义清完全撕破脸后，让小笠原长时彻底失去了一大助力，从而无法进一步在府中一带扩大战果。
小笠原长时也对此感到十分自责，甚至还有了要切腹自尽的想法，但是被其重臣二木重高阻拦了下来。毕竟眼下还有小岩岳家、平濑家、二木家等国人领主、地头武士还在继续支持着小笠原家，小笠原长时还没到孤家寡人的地步，因此打消了切腹自尽的想法。
由于小笠原家军议评定决策之效率、战败恢复之速度、征发兵力劳役之规模、粮草辎重之通畅、领内府库之厚薄、军械装备之精良、器械制作之高下、商旅周流之闭合、民气战心之高低······样样都不及武田家的一半，小笠原长时因此只能率军就此退回了二木家的居城中塔城继续固守，同时派遣其弟小笠原清鉴装作僧侣的样子前往越后府中，寻求越后上杉家的援助。
即便小笠原长时主动收兵退回了中塔城，武田晴信还是不死心的想要千方百计的攻灭小笠原家。武田晴信之后在深志城稍作休整，就以洗马家、山边家、濑黑家、西牧家、仁科家、坂西家等原隶属于小笠原家旗下的国人领主、地头武士为先阵，攻向了中塔城。
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