解释一：止水的右眼的查克拉太过强大，压制了柱间细胞；
解释二：止水的本身就有柱间的查克拉。
我倾向于解释二，论强大，我还是站初代细胞。
之前关于初代的讨论，我已经很详细了。基本结论就是：木遁的力量只能通过移植初代的细胞来得到，初代的后代是不会有的。所以：止水只能是移植了柱间的细胞。
初代细胞有很强大的反噬宿主的能力，如果止水真的被移植了柱间的细胞，那么移植处应该有一个初代的脸。就像斑或者团藏一样。如果是这样的话：即使生前没暴露，死后也该暴露了。除非，处理后事的是知情人。
有可能有止水身体的人：1，宇智波一族；2，团藏；3，带土。4，尸体失踪。我们一个一个的来看：首先排除带土，理由很简单，因为都没有将止水秽土转生，所以带土那里没有止水的尸体。如果带土有，那恋母癖黑绝早就把将其交给兜了；第二我们排出宇智波。至始至终，宇智波就是拿着个遗书来说事。还说什么想让暗部帮助协助调查。估计止水是投河死掉的这一事实，也是暗部告诉他们的。所以最后剩下两种可能，这两种可能实际上一样：都不会泄漏止水移植了柱间细胞的事实。而鼬知道这一事实，所以才对鸣人说：没有柱间细胞，十年不会发动了。
有人要问：止水既然移植了柱间细胞，那为啥没开轮回眼？这个可以参考带土，因为他们移植的是上一代阿修罗转世者的细胞，而且他们本身也不是因陀罗的转世者。所以：他们不会开轮回眼。
那么为什么止水要移植柱间细胞呢？因为别天神的能力太过bug，可以说比神威还bug。首先我们知道非宇智波一族的身体使用写轮眼要耗费更多的查克拉。例证就是：精6的卡卡西与精5的鼬。后来我们也知道即使事纯正宇智波子嗣还有一半白绝身体的带土，也很难控制轮回眼强大的瞳力。后来我们还知道了，即使是因陀罗转世的佐助，他的轮回眼也有严重的CD时间，经常需要恢复瞳力。而其他人更多的是恢复查克拉。佐助在恢复瞳力时，轮回眼彻底不能用，跟佩恩用完超神罗天征后只是天道不能用，存在着质的区别。如此这般恢复瞳力，纵观火影全篇也只有止水的别天神了。团藏有柱间细胞，所以，CD时间短以小时计算；鼬没有，CD时间以十年计算。
这佐助与止水如果存在共同点的话，那就是单凭宇智波的身体，还不足以使用这么bug的能力。经兜之手，佐助身体内有了柱间细胞，但不够多。
当然你也可以认为，止水没有被移植柱间细胞。他右眼的瞳力强大到遮盖了团藏右臂上柱间的查克拉。而没有他的肉体，别天神的cd时间会变的非常长，也只有柱间细胞可以缩短一下这个cd时间。
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