就在李朝的战事打得一路拉稀时，作为宗主国的大明也正时刻关注着李朝方向的消息。
囿于宋洲截断了李朝与明朝陆上的直接联系，使得两果间的消息传递十分不畅，兵部尚书石星不得不暗中遣镇抚林世禄、崔世臣等人前往李朝接触，又派夜不收前往宋洲与李朝秘密勘察。辽东副总兵杨五典、镇抚张奇功等将领也派人渡海，探查李朝的果内情形。
老熟人梁子与万历十九年（1591年）为言官所劾，称他“贵极而骄，奢侈无度”，而且还有杀良冒功的嫌疑。十一月，万历帝听从御史张鹤鸣的建议，罢免了李成梁在辽东的职务。
明面上，梁子确实有如上做得过火的地方，实际上在这背后还有明廷的官场变化，梁子只是权力争斗的牺牲品。另外，宋洲布置在明朝的暗线亦有添油加醋。总之，梁子随着在内阁的靠山申时行、许国、王锡爵等人相继去职，一下失去依托，最后只得告老还乡。
不过，梁子的几个儿子已经展露锋芒，李家将门仍然在军中颇具影响力。
如今主持辽东大局的武将能力要比梁子差上许多，这帮人捞钱或许是把好手，但也怕李朝出现什么乱象，最后大火烧到自己。
早在四月中旬，倭军登陆釜山浦，向王京高歌猛进时，明朝就接到了情报。但当时明廷对要不要做援救准备，尚没有定论，而且好巧不巧的是明朝西北还在平定叛乱之中。
发生在西北的叛乱便是万历三大征之一的哱拜之乱。
哱拜原为鞑靼人，嘉靖年间降明，因积战功，后升任都指挥。万历初为游击将军，统标兵家丁千余，专制柠夏，多蓄亡命之徒，为其所用。万历十七年（1589年），哱拜以副总兵致仕，子哱承恩袭职。
万历十九年，火落赤等部犯边洮河，御史周弘禴推举哱承恩与指挥土文秀、哱拜义子継云等人带兵出征。巡抚党馨却只令土文秀西援，哱拜又谒见经略郑洛，表示愿意与儿子承恩一同出师。党馨已对哱拜父子心生警惕，故意压制他，哱拜因此心生怨气。到金城，看见各镇士兵都出于他的手下。等击退叛贼，取道塞外回来时，敌方骑兵遇到他都避开，这让哱拜生出轻视中原内外之心。党馨数次裁制哱拜，并且按治承恩罪行鞭打了他二十下，継云、土文秀也因为其他原因怨恨党馨。恰好有戍卒请拨衣服、粮食，很久都没有得到。哱拜便唆使军队先锋刘东旸、许朝犯上作乱。
万历二十年（1592年）二月十八日，哱拜与刘东旸纠集部众，举兵反叛，杀死巡抚党馨及副使石继芳等明朝官员，逼着总兵张惟忠以党馨“扣饷激变”奏报，一时之间，哱拜占据了河西四十七堡，据柠夏称王。史称“势大猖獗，全陕震动”。只有参将萧如薰坚守平虏城不投降。
哱拜扯旗造反后，打算效法宋时西夏旧例，占据西北，故而连连出击，攻城略地。消息传至京城，明廷震惊，随即做出反应，任命三边总制魏学曾为西北总督、总兵麻贵、刘昫率领延绥、榆林、兰靖、庄浪四镇兵马进剿，而浙江道御史梅国桢也在朝廷上大力主剿，并担任监军，同时副都御史叶梦熊等也率1500苗兵、右副都御史常居敬也率1000浙兵前往，之后又调宣府总兵梁子的儿子李如松提督军务，统率四镇军队进剿。
平叛一开始，明军进展顺利，收复了不少城池。哱拜知道以自己的力量对抗明朝无异于以卵击石，于是引鞑靼人前来相助。
三月四日，总督魏学曾恢复河西四十七堡，唯柠夏镇迟迟不能收复，便调副将麻贵驰援，四月，又调李如松为宁夏总兵等进行围剿。并以梅国桢为监军，统辽东、宣、大、山西兵及浙兵、苗兵等进行围剿。
历史上，到了七月份，麻贵便捣毁了套部大营直接打到了贺兰山。原本哱拜仗着有鞑靼人的援助，想与明朝拉锯，眼下见此也有些慌了。
魏学曾后因玩忽职守下罪，接替总督之位的叶梦熊统率各路部队将柠夏城围得水泄不通。兵部尚书石星献计可用水攻，于是明军利用黄河水把柠夏城给淹了。
城中弹尽粮绝，又遭水淹，人心浮动，很快就发生了内讧。九月十六日，刘东旸杀土文秀，哱承恩杀许朝，后周国柱又杀刘东旸，乱兵由此军心涣散。李如松破城后，带兵包围哱拜家，哱拜自缢，合家自F。哱拜次子承宠、养子哱洪大、土文德、何应时、陈雷、白鸾、陈继武等被生擒。哱拜之乱耗时七个月，自此平定。
哱拜之乱虽然最终平定，但明廷在这期间掏了数百万两的银子，负担不轻。因此，明廷对于要不要援救李朝还是充满犹豫的。
兵部尚书石星是坚定的出兵派，但他又不属强硬派，幻想像处理俺答汗与宋洲一样，以封贡条件，换取倭国罢兵。石星之所以有这样的态度，是受幕僚沈惟敬的影响。
沈惟敬是嘉兴人，壬辰战争爆发前还是一介平民。其出身平湖名家清溪沈氏，其父沈坤“家颇饶，不为产业计”。
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