以倭国的历史来看，他们就是欺软怕硬，只有彻底打服他们以后才能更好的控制他们。
又安排人通知岛津忠恒和松浦隆信自己已经占领了，让他们准备好应对接下来德川家的反攻。
当岛津忠恒和松浦隆信收到黄煜的传信时，确实惊了一下，虽然他们知道长崎的守军并不太多，但是黄煜福建军的实力确实惊到他们了，一上午时间就解决了长崎的5000千守军，看来以后他们要多防着点黄煜了，不能赶走了狼又引进来一头虎。
黄煜忙着在长崎建立防线以实现对永久占领时，德川义直带着100多德川家的溃兵逃到了平户，找到松浦隆信向他说明了长崎被不明人员攻占，疑似是大明的水师，让他多加防备；又向松浦隆信借了一艘船，要尽快赶回江户向德川家光禀告此事，想办法重新夺回长崎。
黄煜这边为倭国的计划在长崎忙碌的时候，他当时送去京城的倭寇头颅和琉球国王的奏折，也在京城引起了一阵轰动；虽然从戚继光和俞大猷等抗倭以后，很长一段时间倭寇有所减少，但是近些年倭寇再起为祸沿海，前些年就收到过琉球王的求救信，但是大明自身麻烦一堆，更没有精力派遣舰队远征帮助琉球，所以就不了了之了。
现在没想到居然被黄煜给解决了，但是黄煜先前并没有向朝廷请旨，虽然后来补了一份奏折但是这也给了那些文官攻击的借口。
本来魏忠贤为安奢治乱十分的烦心，经历这么长时间依然没有完全剿灭，更是牺牲了多位高官，现在虽然收复了四川等地，但是西南连年战乱导致赋税严重损失，当前大明正在全力防备东北的后金，全国的重点都放在了东北方；为此特诏增加盐税，除陕西河东池盐以及云南旧额不增外，其两淮、两浙、长芦、山东、福建、广东、四川共增课五十四万七千九百九十三两。
魏忠贤通过这次救助琉球的事，看到了黄煜的能力，打算调黄煜去负责平定安奢治乱，已经在大朝上提出了建议，但是文官们以黄煜无旨出兵，擅自挑起战事为由不但不同意让黄煜总领军务平定安奢治乱，反而要治黄煜之罪。
支持派和反对派两方展开了浩大的对战，如果让黄煜知道他现在居然能在大明朝堂引起这么大的争执的话，肯定会非常惊讶。
最后魏忠贤和反对派做了一个赌注，如果两个月内能够平定安奢治乱，提拔黄煜的事就此作罢，但是如果解决不了那就只能让黄煜总领平叛事宜。
这也是这么长时间朝廷对黄煜的封赏一直没有下来了原因，但是就算黄煜知道了也不会在意，现在福建军都在他的掌控之下，不是说想把他撤职就能撤职的。
终于运送后勤装备的船队再次来到了长崎，黄煜把长崎的工作全部交给了林远清、章天雷、王祥雨、冯宝之，以后最少要一个人在长崎，无论如何要确保长崎不能丢失；之后就随船队回了台湾，这次出来一个多月了，再加上福建和台湾的兵马都出动了这么多，他还真有点不放心。
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