和人类的免疫功能类似。细菌会把细胞内存在的所有DNA都一一抓来和CRISPR序列仔细比对，一旦发现两者完全一致，就意味着病毒在细胞内出现了，于是立刻启动防御机制。
CRISPR就是细菌的记账本，每一次遭到病毒入侵，就会把这个病毒的特征记到本本上，用于秋后算账。当那个不知好歹的东西再一次现身时，便以最快地速度，重拳出击。
具体来说，CRISPR序列会被首先转录成RNA分子，称为向导RNA。这个向导RNA会和细胞内的某种名为Cas的蛋白质结合，形成一种核糖核蛋白复合物，简称为RNP。RNP会像哨兵一样在细胞里勤勤恳恳地终日巡逻。
而这位哨兵寻找的对象，就是任何一段能够和向导完美配对的DNA分子。一旦两者相遇，哨兵就会启动cas蛋白的切割功能，将这段DNA切成一个个小的片段，成功地把敌人给碎尸万段了。
这时，可能有人要问了，细菌里的CRISPR和人类的基因编辑有什么关系呢？
那些可怜的遗传病患者，他们的DNA与正常DNA通常只有几个或几十个碱基不一样，要想修正他们的基因组，就要精确地定位到不一样的地方。否则，只放一些小剪刀进去对着DNA长链乱剪乱切，这人肯定就活不了了。
所以，如何生产一个GPS，让剪刀找到正确的目标再剪，是一个重要的技术难题。
而细菌CRISPR系统里的向导RNA就是这个难题的答案。
如果我们能够在体外合成特定的向导RNA，并让它能够特异性识别某些DNA片段，问题不久迎刃而解了吗？
于是，CRISPR技术便应运诞生了。经过一众科学家十余年的努力，我们可以任意地合成向导RNA和Cas蛋白，由它们俩组成的人工RNP可以通过多种方式被导入细胞，被向导 RNA带到正确的地方，再下剪子。
但是，可能有人要问了，如果这把带GPS的剪子如此好用，我们现在又为什么依然要受到那些基因缺陷疾病的困扰？为什么没有人造生物？为什么没有实现基因飞升？
这时因为，这些可爱的小剪子，有着一些致命的缺陷。
首先，由于各方面的限制，向导RNA不能太长，通常也就是20来个碱基对的长度。要知道，人类DNA上可是有30亿碱基对，区区长度为20的碱基片段，可能在DNA长链中随处可见。
所以这些可爱的小剪刀在发挥作用时，也可能也同时剪到其它奇奇怪怪的地方，造成各种乱七八糟的突变，导致细胞死亡。
其次，小剪刀在发挥作用时，需要目标基因的上游存在一个特定的短的碱基序列，我们称之为PAM序列。如果实际操作中，目标基因上游到处都没有PAM序列，那么即使小剪刀找到了正确位置，也无法咔嚓一刀剪下去。
最后，小剪刀也是有脾气的。有时，它的GPS没有找到完全匹配的DNA片段，但小剪刀就是想剪。于是它便会随便找一段类似的DNA片段，咔嚓一下剪下去。然后转身就走，深藏功与名。
以上三种情况，在专业术语里，叫做“脱靶”。
小剪刀很好用，但奈何小剪刀经常不做人。因此，这项技术的实际效果，目前来说并不理想。
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