狩矢用芳野灵魂制造的大量娃娃比特，到处袭击人类夺取魂魄，尸魂界派出隐秘机动展开调查，非但没有收集到情报还有人被伤。灵魂狩猎者藏身于有特殊矿石的山洞中，通过比特收集并压缩的高纯度魂魄正在积蓄非常强大的力量。为了消灭灵魂狩猎者，通过队长会议，日番谷命令乱菊、吉良、桧佐木和弓亲四人前往现世。而一护等人，在浦原制造出探测仪之前只能漫无目的寻找。
为了测试自己的力量，灵魂狩猎者们倾巢而出。一护戴上甚太和小雨送来的新型探测仪去寻找灵魂狩猎者，而露琪亚则去找灵力突然下降的恋次。在一护寻找灵魂狩猎者时看到了被比特袭击的启吾，为了救出重伤的启吾一护必须打倒挡住去路的古贺。于此同时，相遇的露琪亚和织姬，赶去与一护汇合的茶渡，都各自遇到了灵魂狩猎者的袭击，大家都陷入了危机。
一护在与古贺的战斗中受到重创，看着倒在地上的一护，想到又一个年轻的生命即将逝去，古贺不由得想起了灰色的过去。在狩矢找上古贺之前他一直过着孤独的隐居生活，直到狩矢把一个灵魂狩猎者青年托付给他，在古贺的锻炼下青年慢慢的成长，但是在召唤娃娃的过程中，发生了古贺最不愿提及的回忆。
吉良的及时出现缓解了一护的危机。露琪亚、织姬与灵魂狩猎者的战斗还在继续，而这时马桥突然闯入，第一次吸收活人魂魄的马修神志不清竟然攻击自己的同伴，对方受不了马桥的痴狂自动退出了战斗。马桥的娃娃利兹非常的棘手，使露琪亚与织姬难以招架，就在这时利兹钻入了露琪亚的体内，醒来的露琪亚神情变得很不正常。
被马桥用娃娃控制的露琪亚向自己同伴开始攻击，织姬用盾舜六花艰难的进行这防御，而被利兹强行引出力量的露琪亚脱离义骸后使出了更强力的攻击。面对被控制的露琪亚，连及时赶到的桧佐木也束手无策，这时恢复了些许意识的露琪亚请求织姬攻击自己，看到这些的织姬擦干了眼泪拿出决心，把自己的信念化作盾舜六花的力量向露琪亚走去。
茶渡、之芭和小雨三人与突然出现的灵魂狩猎者泽渡对峙，乱菊的出现完全打破了这种紧张气氛，竟然忽视灵魂狩猎者与茶渡他们友好的问候，经过之芭的提醒才知道眼前这个老头就是敌人。与他们对峙的泽渡操纵着名为保拉的娃娃，保拉拥有和之芭一样操纵空间的力量，可以产生特殊异空间在里面游走，面对这个麻烦敌人，乱菊等人该如何应对？
保拉从之芭的异空间内挣脱，使之芭受到严重的伤害，就在三人遇到危险时，之芭又一次把大家转移至安全的地点。在众人的商讨下有了应对的办法，结合乱菊的鬼道和之芭的探测能力，预测到了保拉出现的位置，而茶渡趁机攻击它脆弱的腹部，用这个方法他们成功救出了小雨。与此同时，瀞灵廷内也不太平，巡视的一角遇到了隐藏气息的入侵者。
一护一行人拖着疲惫和伤痛聚集在浦原商店，大家分别接受治疗和休息，尸魂界内白哉接到通知也展开了对叛离死神协助灵魂狩猎者一事的调查。与此同时，找到了灵魂狩猎者藏身山洞的弓亲，与乱菊、吉良、桧佐木四人一起想要亲手做个了解，但在山洞内等着他们的是宇柿利用人偶凯瑟鲁设置的陷阱，在危险的陷阱内四人可以全身而退吗？
继乱菊四人之后，一护等人也来到了灵魂狩猎者藏身的山洞，但是他们也同样对宇柿的娃娃凯瑟鲁的能力束手无策，从乱菊口中知道了凯瑟鲁的攻击是从发光的眼睛制造出的阴影里出来的，茶渡留下照顾受伤的众人，一护和恋次向山洞深处突破。石田为了恢复灭却师的能力独自在深山修炼，这时十二番队副队长涅音梦出现，不由分说便攻了上来。
四面聚集的光线在地上投射出巨大的阴影，挡住他们去路的是凯瑟鲁的本体，想要独自战斗的恋次站在了一护面前，恋次一直悔恨因为自己的疏忽连一个人类的小孩也没能保护好，决定重新振作起来的恋次使出了卍解，在狒狒王蛇尾丸的攻击下，宇柿被自己暴走的娃娃杀死。战斗结束后，一护先行找到狩矢他们的据点，而这时通往异界的门已经打开。 死神和灭却师 恢复了的力量
狩矢的真正目的竟是向尸魂界复仇，灵魂狩猎者的诞生是由于尸魂界的一次实验事故，异于常人的他们很怕被别人发现而四处逃避，死神们面对悲惨的他们非但没有负出该有的责任还想把他们从历史中抹去。即便知道这点一护还是不能原谅牺牲无辜的他们，使出卍解之后与狩矢势均力敌的战斗，而这时赶来的石田用自己恢复了的力量做出了大家意想不到的事情。 突入死神世界，再次
狩矢等人成功来到了尸魂界，当日番谷赶到流魂街时，现场只剩下被打败的大前田与射场。为了打败灵魂狩猎者，一护等人再次来到尸魂界，找到空鹤的住处后众人一起商议，从夜一的口中得诞生灵魂狩猎者的那次实验尸魂界并没有任何记录，而参与实验的兰岛就在流魂街的某处，一护等人各自前去寻找兰岛和灵魂狩猎者的踪迹。 巴温特强攻！强烈震动的护庭十三队
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