关键之后又发生了僧兵利用夜色偷袭大龙朝的舰队，焚烧了一艘三等战船，这激起了大龙朝的报复心，造成了千叶城大屠杀事件的发生，使东夷平民更加痛恨寺庙僧兵。
很快就出现了大名对本辖区内的寺庙僧兵进行镇压的消息，有一就有二，整个东夷大名都开始镇压辖区内的僧兵，大名们向天皇和松平幕府上书，要求寺庙只能研究佛法，不能私蓄僧兵，所有僧兵交出武器，全部改为武士或流放。
有激进的大名直接派出自己的武士开始攻打辖区内的寺庙，织田秀雄就攻打了延历寺，杀死了上千名僧兵，烧掉了寺庙，有的大名则放火烧寺，赶尽杀绝所有僧兵，收缴寺庙的财产和田地。
各大名纷纷消灭领地内的僧兵，兼并寺庙的土地。还有筒井家这种自动将僧兵转化为自己的武士。寺庙僧兵，看着很凶，实际战斗力低于武士，他们根本就不是大名武士的对手，只是以前由于神佛的权威和平民无条件的信仰，各地大名均不敢得罪寺庙而已。
现在的东夷天皇是政仁天皇，松平幕府为了控制天皇，就将自己的女儿松平和子嫁给了政仁天皇，松平秀忠希望自己女儿出生的孩子将来能够继承天皇位。
在各地大名的提议下，整个东夷平民的呼声下，松平秀忠为了加上中央集权的管理，进一步加强对寺庙的控制，没收僧人大量兼并平民的土地，于是在八月制定了《宗教限制条例》，由天皇签字后下发各大名，《宗教限制条例》对东夷各宗教进行了限制。
《宗教限制条例》规定兵器必须要有幕府的许可证才能持有，而僧兵由于不是幕府认定的武士或祭祀人员，无法合法持有兵器。这导致僧兵以后难以继续存在，最终逐渐湮灭在历史中。
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