第九使徒甩出长手臂扣住二号机的头颅往下摁，二号机插入栓内的明日香忍不住疼呼一声，下意识的抓住第九使徒的手腕。
被第九使徒顺势扣倒在地上，肩膀处手臂拎起二号机半空中。
呼——咚！！！
“二号机头部被侵蚀！现在正向插入栓内驾驶员感染！”
“驾驶员和二号机同步率逐步下降！”
初号机内的碇真嗣看着眼前这一幕慌了神，他刚想上前帮助二号机时，第九使徒把拎在手中的二号机砸向初号机！
咚——哐哐！！！
二号机四颗绿色眼睛闪烁几下，最后慢慢熄灭变得黯淡。
NERV总部基地
指挥室
青叶茂：“二号机和驾驶员神经系统断连！驾驶员头部遭受使徒污染！目前已经没有作战能力！”
此时二号机插入栓内的明日香，正心慌的来回推动魂之座两侧的操纵杆。
她只感觉自己的左眼火辣辣痛，像有什么东西在进入眼珠子里。
无论明日香怎么操作魂之座的操纵杆，二号机丝毫没有反应，最后插入栓内熄灯陷入黑暗，一道虚拟面板出现在明日香的面前——神经系统发生故障！警告！警告！警告！
“可恶！你以为我会因为这些就搞不定你了吗？开玩笑……唔……咳！！”
咚——叮！！！
明日香眼前一黑，失去意识瘫倒在魂之座上。
在陷入昏迷的最后一刻，她还在想着能不能再次见到黄哲田。
处理完二号机的第九使徒，摇摇晃晃向正狼狈起身的初号机走去。
初号机放下二号机，插入栓内的碇真嗣握住操纵杆的手如今止不住颤抖。
指挥室内的碇源堂看着眼下这战局，用质问的语气问碇真嗣：“碇真嗣，你为什么害怕战斗？”
初号机握住匕首的手松开再紧握，碇真嗣眼神虽然害怕，但语气却十分坚决对碇源堂说：“因为黄哲田还在机体内啊！爸爸！我不知道怎么办！？我下不去手啊！”
碇源堂听到碇真嗣说出这番话，语气变得有些不喜：“现在这些都没关系了！你眼前的目标是使徒！它是我们的敌人！”
轰！！！
第九使徒一脚踏出冲到初号机面前就是一个狠狠地抱摔！
还顺便把初号机的背部电缆线给扯断，然后抬起脚用力一踢，初号机摩擦着地面一路翻滚撞击，最后撞在一座山坡上停下来。
体内电源4：57：48
碇真嗣疼得冷汗直冒，但心中还是放不下对生命的敬畏，以及友谊。哪怕对方已经不再是过去的伙伴。
“可是我做不到啊！我没有杀人的想法啊！”
碇源堂：“那最后的结果是死的那个人就是你！”
碇真嗣破罐子破摔，怒吼道：“都无所谓了！总比让我去杀了黄哲田还好！”
碇源堂听到儿子说这些对他来说是无脑的话后，不再解释，而是直接下达启动傀儡系统命令：“不管了，切断驾驶员和初号机的同步连接！”
冬月耕造有些不确定问道：“碇？你确定要这么做吗？”
傀儡系统现在还处于实验性阶段，没有通过实战来获取有效资料。
伊吹听后最后还是再次询问：“真的要切断吗？”
冬月耕造的担忧是傀儡系统来操控初号机打不出实战效果，没有对敌人进行有效伤害。
伊吹的犹豫是害怕傀儡系统接管碇真嗣对初号机的控制权，造成的后果怕驾驶员承受不住。
碇真嗣语气毋容置疑：“是的，将操纵权交给傀儡系统。”
伊吹：“但是傀儡系统还有很多问题，也没有赤木博士的指示。”
碇源堂：“起码比现在的驾驶员有用！
快点！”
最后一句话是碇源堂极为不耐烦低吼伊吹，你是司令，还是我是司令啊？
伊吹听后只好答应：“是！”
初号机插入栓内
滴——嗡！！！
碇真嗣突然感觉身体的痛疼像被抽离一样，迅速消失。
就在他松一口气的时候，插入栓变得极其诡异！
红色的警示灯亮起，魂之座背后装着的傀儡装置被启动。
经过几次折叠后，傀儡装置从背后翻过来，两条机械连接手罩锁住碇真嗣握在操纵杆上的双手。傀儡头罩也慢慢遮住碇真嗣的面庞。
等碇真嗣反应过来时，他已经完全被傀儡系统控制住了！
碇真嗣的直觉告诉自己，眼下的他比面对使徒的作战还要可怕！！
内心的警铃不断敲打，碇真嗣心急如焚对总部呼叫：“这到底是什么？！你要干什么？！爸爸！！！”
碇源堂充耳不闻，没有理会碇真嗣的呼喊。
伊吹：“主控制系统切换完毕！”
“所有神经回路与傀儡系统连接完毕！”
“傀儡系统的最长活动时间在208秒，初号机现活动时间是4：28。”
碇源堂：“没关系，解放系统，开始攻击！”
轰！！！
初号机双眼爆红，口部拘束器被强行挣脱。
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