到达后，艾丽发现这种黑色物质具有高度腐蚀性和吞噬性，普通防护措施完全无效。她带领队员采集样本进行分析，发现这是一种人工合成的暗物质，只有找到合成源头才能彻底阻止它。艾丽顺着暗物质蔓延的方向追查，发现一艘隐藏在小行星带后面的巨大飞船。
艾丽率领舰队向飞船发起攻击，然而飞船的防御极为坚固。这时艾丽发现飞船表面有几个能量聚集点，推测是维持防御罩的关键所在。她组织精锐队员乘坐小型冲击艇冲向能量点。经过一番苦战，成功击破能量点，防御罩消失。艾丽等人攻入飞船内部，关停了暗物质制造装置，三角座星系的危机解除。艾丽再次望向宇宙，准备迎接下一个未知的挑战。
艾丽刚要带队返程，飞船的通讯系统突然接收到一串奇怪的代码。艾丽尝试解析，发现这是一个坐标位置，附带一条讯息：“来此，真相待揭。”艾丽心生好奇，决定前去一探究竟。
按照坐标到达指定地点后，只见到处漂浮着残破的星际战舰残骸。艾丽警惕地前进，突然，周围空间泛起涟漪，一艘庞大的隐形母舰缓缓现身。还没等艾丽做出反应，一道光束射出笼罩住她的舰队。
紧接着，一个声音在艾丽脑海中响起：“你们总是破坏我们的好事，现在轮到你们尝尝被掌控的滋味。”艾丽明白这是新的敌人。她冷静地指挥队员启动反制系统，同时寻找对方的破绽。
艾丽发现光束发射口是能量汇聚之处，若能破坏此处或许可脱困。她率领一小队精英成员，借助战舰掩护悄悄靠近敌舰。在敌人疏忽之际，艾丽成功命中目标。光束消失，艾丽乘势反击，一举击溃这艘神秘母舰。艾丽知道宇宙中危险无处不在，但她毫不退缩，又踏上了回归总部之路，随时等待下一次挑战的到来。
就在艾丽以为终于可以松口气的时候，舰队中的探测仪发出警报声。原来是刚刚那场战斗产生的能量波动引来了一群宇宙海盗。这群海盗常年游荡在各个星系之间抢夺资源，看到艾丽舰队伤痕累累便打算趁火打劫。
艾丽迅速调整状态，她深知这批海盗狡猾多端不易对付。于是她命令舰队分散开来，伪装成遭受重创失去战斗力的样子。海盗们见状大喜，毫无防备地靠近。
当海盗船接近到最佳射程内时，艾丽一声令下，舰队火力全开。海盗们顿时乱作一团，但他们也不甘示弱，发动疯狂反扑。艾丽亲自驾驶一艘战舰冲入敌阵，直捣海盗旗舰。经过一场激烈的近身搏斗，艾丽成功登上旗舰，制服了海盗首领。
其他海盗群龙无首，纷纷投降。艾丽收缴了海盗的物资补充舰队消耗之后，带着胜利的成果顺利返回总部。这次经历让艾丽更加意识到，在这充满未知危险的宇宙中，必须时刻保持警惕，而她也将永远站在守护和平的最前线。
回到总部后，艾丽受到英雄般的欢迎。但她没有沉浸在荣耀之中，而是一头扎进研究室，对之前缴获的海盗装备以及遇到的各种外星科技进行分析。
在研究过程中，艾丽发现所有这些东西背后似乎都有着某种微妙的联系，像是有一只无形的手在操控着一切。正当她深入探寻时，总部突然接到来自银河系边缘殖民地的求救信号。那里遭遇不明生物袭击，居民死伤惨重。艾丽主动请缨前往救援。
抵达目的地后，艾丽发现这些不明生物竟然拥有智慧，而且它们的攻击方式融合了之前所遇敌人的部分特点。艾丽意识到这绝非偶然，这背后必然隐藏着更大的阴谋。
她一边指挥抵御攻击，一边收集这些生物的数据。经过艰苦奋战，暂时击退了不明生物。艾丽通过数据分析发现，这些生物体内有一种特殊标记，与之前那串奇怪代码中的一部分相匹配。
艾丽预感自己离揭开真相越来越近了，她决定沿着这条线索继续追查下去，哪怕前方是无尽的黑暗与危险。
艾丽顺着标记追踪而去，来到一颗荒芜的星球。这里弥漫着诡异的气息，四处都是残垣断壁。艾丽小心翼翼地探索着，突然脚下触动机关，一道暗门打开。
艾丽带领队员进入暗门，里面竟是一个巨大的实验室。实验台上摆放着各种生物样本和图纸，艾丽仔细查看，发现这些都是创造那些不明生物以及之前种种危机的设计图。
正在此时，一群机械卫兵冲了进来。艾丽和队员们立刻投入战斗，艾丽凭借高超的战斗技巧冲破机械兵防线，找到了控制终端并入侵它。随着程序破解，机械兵停止行动。
艾丽在终端里发现一段视频日志，揭示出幕后黑手是一个妄图统治宇宙的极端组织。他们利用各种科技制造灾难，以削弱各星系力量便于控制。
艾丽深知事情严重，她将证据传送回总部，并决心彻底摧毁这个组织。艾丽带领队员向着组织核心区域进发，准备迎接最后的决战。
艾丽等人潜入核心区域，却发现四周空无一人，安静得可怕。突然，周围场景变幻，众人置身于一个虚拟迷宫之中。艾丽意识到这是敌人设下的陷阱，企图困住他们。
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