1866年，左宗棠出任陕甘总督，他肩负起了平定陕甘地区回民起义和抵御外敌入侵的重任。在陕甘地区，左宗棠面临着复杂的局势和严峻的挑战。
一方面，陕甘地区的回民起义此起彼伏，给当地的社会稳定和人民生活带来了极大的破坏；另一方面，阿古柏的势力不断扩张，对中国的西北边疆构成了严重的威胁。
为了平定陕甘地区的回民起义，左宗棠采取了“剿抚并举”的策略。他在军事上对回民起义军进行了坚决的打击，同时也积极开展招抚工作，争取回民起义军的归顺。经过多年的艰苦战斗，左宗棠终于成功地平定了陕甘地区的回民起义，为他进军新疆创造了有利的条件。
1867年，阿古柏在南疆地区自立为汗，建立了“哲德莎尔国”，公然分裂中国领土。
1870年，阿古柏的势力进一步扩至北疆部分地区，中国的西北边疆面临着前所未有的危机。沙俄趁火打劫，进犯伊犁地区，并公然宣布对伊犁实行“军事占领”。
沙俄与阿古柏签订了“俄阿条约”，承认“哲德莎尔国”的合法地位，妄图通过支持阿古柏来达到分裂中国的目的。
1874年，英国也与阿古柏签订了“英阿条约”，承认“哲德莎尔国”，并向阿古柏提供武器和军事援助。在这种情况下，中国的西北边疆岌岌可危，新疆的局势已经到了非解决不可的地步。
1875年，清廷内部就新疆问题展开了激烈的争论。以李鸿章为代表的“海防派”认为，中国的主要威胁来自海上，应该集中力量加强海防，而新疆地处偏远，土地贫瘠，收复新疆不仅耗费巨大，而且得不偿失，因此主张放弃新疆。
而以左宗棠为代表的“塞防派”则坚决反对这一观点，他们认为新疆是中国的西北门户，战略地位十分重要，如果放弃新疆，不仅会使中国的领土完整受到严重损害，还会使中国的西北边疆陷入更加危险的境地。
左宗棠力陈新疆的战略重要性，他指出：“重新疆者所以保蒙古，保蒙古者所以卫京师。西北臂指相联，形势完整，自无隙可乘。若新疆不固，则蒙部不安，匪特陕、甘、山西各边时虞侵轶，防不胜防，即直北关山，亦将无晏眠之日。”
他的这一观点得到了慈禧太后的支持。慈禧下达了“三十年不准参奏左宗棠”的指令，这一指令给予了左宗棠极大的支持和信任，使其能在相对稳定的环境下筹备和实施收复新疆的军事行动。并任命他为钦差大臣，督办新疆军务。
左宗棠深知收复新疆的任务艰巨，困难重重。为了筹集军费，他多次向朝廷上书，请求拨款。同时，他还积极向洋商借款，并向各省协饷。在他的努力下，终于筹集到了足够的军费。
1876年，年逾六十的左宗棠抬棺出征，率领七万左右的湘军等部队西征。当时新疆局势危急，沙俄等势力妄图侵占新疆，而朝廷内部“海防”“塞防”之争激烈。
左宗棠力排众议，坚持收复新疆。向朝廷、向将士、向世人表明他此次出征绝不退缩，哪怕牺牲生命也要将新疆从侵略者手中夺回，扞卫国家领土完整的决心。这一举动极大地鼓舞了士气，展现了他的爱国情怀和英勇无畏的气概，激励着全体将士奋勇作战，为收复新疆奠定了精神基础。
他采用了“先北后南、缓进急战”的战略，在进军新疆之前，他先对军队进行了整顿，加强了军队的训练和装备，提高了军队的战斗力。
同时，他还积极争取新疆各族人民的支持，他向新疆各族人民宣传了收复新疆的重要意义，得到了新疆各族人民的热烈响应和支持。在北疆战场上，左宗棠指挥清军稳扎稳打，步步为营。
他充分利用清军的优势，对阿古柏的军队进行了有力的打击。经过多次激战，清军成功地收复了北疆地区。接着，左宗棠率领清军南下南疆，向阿古柏的势力发起了最后的进攻。
在南疆战场上，清军面临着更加艰苦的战斗。阿古柏的军队在南疆地区经营多年，拥有坚固的防御工事和强大的军事力量。但是，左宗棠并没有被困难所吓倒，他指挥清军采取了灵活多变的战术，与阿古柏的军队展开了激烈的战斗。
1877年底，除伊犁地区外，清军成功地收复了新疆其他领土。
为了收复伊犁地区，左宗棠一方面在边境陈兵，准备与沙俄一战，展示了中国的强硬态度；另一方面，他通过外交手段与沙俄进行了艰难的谈判。在谈判中，左宗棠坚决维护中国的领土主权，他向沙俄表明了中国收复伊犁的坚定决心。
在左宗棠的努力下，沙俄最终认识到了中国的决心和实力，不得不做出让步。1881年，沙俄与中国签订了《伊犁条约》，归还了伊犁地区，新疆大部分领土重回祖国怀抱。
收复新疆后，左宗棠并没有因此而放松对国家的关注和责任。他继续为国家的稳定和发展积极建言献策。他主张在新疆设立行省，加强对新疆的管理和建设，促进新疆的经济发展和社会进步。他的这一主张得到了清廷的采。
1884年，新疆正式设立行省。左宗棠还积极推动洋务运动，他在福州创办了福州船政局，培养了一批优秀的海军人才和技术工人，为中国的近代化进程做出了重要贡献。
1885年9月5日，左宗棠在福州病逝。他的一生，是为国家和民族的命运而不懈奋斗的一生。他在太平天国时期展现出了卓越的军事才能，平浙闽、靖陕甘，为维护清王朝的统治做出了重要贡献。
他以坚定的信念、卓越的领导才能和无畏的勇气，成功地守护了国家的领土完整，为中华民族立下了不朽的功勋。他的事迹和精神，将永远铭刻在中国历史的长河中，激励着后人不断为国家的繁荣富强而努力奋斗。
左宗棠的一生，充满了传奇色彩。他出身平凡，却凭借着自己的努力和才华，成为了晚清时期的一位重要人物。他的军事才能、政治智慧和爱国精神，不仅在当时产生了重要的影响，而且对后世也产生了深远的启示。他的故事永远激励着我们为实现中华民族的伟大复兴而努力奋斗。
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