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第二十七章 信息生命体(七)

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细胞周期网络在信息结构上表现出与随机网络相区别的特征模式,控制核节点通过控制有关结构的全局因果(状态转换图中的因果流),在网络信息传递中起主导作用,调节着系统全局状态转换。

图5:裂殖酵母细胞周期调节的布尔网络模型。节点代表调控蛋白,边缘表示节点之间的两种生化作用:激活(以箭头结尾)和抑制(以条形结尾)。其中红色节点是控制核,当固定在特定值时,它可以调节网络的全局行为。该图根据 Davidich 和 Bornholdt(2008)和 Kim 等人(2013)的数据重新生成。

图6:裂变酵母细胞周期网络中的信息架构和因果结构。a ER(绿色)和 SF(蓝色)网络集成处理总信息的分布。每个数据点表示在x轴上,传输的给定信息总量的各个集合中的单个网络的数量。b 裂变酵母细胞周期中成对节点间传递熵的标度,ER和SF网络分别用红色、绿色和蓝色表示。对于1000个网络的样本,计算每个随机网络集合的平均值和标准差。虚线之间的区域表示裂变酵母的信息标度在生物学上独特的范围。c 裂变酵母细胞周期网络信息传递的标度关系。CK 表示控制核节点,而 NCK 则是一组不包含在控制核内的节点。所示数据与中间面板中裂变酵母传递熵的标度模式相同。根据一对中每个节点是在CK还是在NCK中,标度模式被分为四类信息传输。这些数字来自 Kim 等(2015)(在线彩色图)

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