广西道试御史萧奕辅指责孙元化放任孔有德，又说张焘“卸罪于波涛，借词于风汛”。
他们明着指责孙元化，潜攻东林出身之大学士周延儒，要求废止东江、登州两镇。
第三派是部分支持孙元化的东林分子组成的中立派。他们开始主张招抚叛军，后来中王道纯流言，认为孙元化已经叛变，转而大力支持镇压。孙元化主动返回京师，他们意识到自己单凭流言上书皇上，已经构成诬陷同僚罪。承认错误就要承担后果，没有人愿意承担后果。他们索性将错就错一错到底，一口咬定孙元化罪大恶极，罪不容诛，罪该万死。中左两派合力攻击右派。
曾经力主处死袁崇焕的温体仁，公开诬陷当朝首辅周延儒收过孙元化贿赂，所以给孙元化开脱。指责徐光启保护孙元化的原因是他们不仅是师徒，更是儿女亲家，典型的徇私枉法无父无君。
温体仁还给吴桥兵变的巨大损失列出清单反颜皇上，质问崇祯帝是不是个秉公办事的明君。
大量目光短浅刚正不阿的白痴受其影响对孙元化穷追猛打不死不休，根本没有想过命他戴罪立功挽回损失。
崇祯帝为了表示自己是位执法如山的明君，下令处死孙元化。
孙元化被斩不到一年，徐光启就因为伤心失意死去。他的离去意味着西方科技派在华夏大地上彻底消亡。
朝廷的死刑判决下达之后，王徽到死牢探望，孙元化在好友丝带上写道：“不意一片痴肠，终成大梦，潦倒诏狱，卧废已死。”
几日后老外汤若望买通关节，化妆成收粪工进入镇抚司诏狱给孙元化做最后的弥撒。孙元化托这位教友给自己的三个儿子传话：“不准因为父亲被冤杀而报怨朝廷。不要当官，要把我的遗作整理出来献给国家。”
孙元化对国家民族的忠诚惊天地泣鬼神，奈何他感动天感动地，唯独感动不了汉猪。他的冤死是中华民族的巨大损失。
孙元化死后，他的同伴纷纷遭到清算：张焘处死，宋光兰、王征、余大成充军，王徽罢官谪戍。
自然科技在中国的传播发展就此停滞三百年，使得大汉民族先后被满族、西洋、东洋殖民四百年。
林则徐为向殖民头子满清皇帝谄媚，在对西洋一无所知的情况下就敢撕破脸皮暴力禁烟，最后被人家打得满地找牙，暴露出满清的腐败虚弱，导致西洋同满清王朝对中华大地的殖民争夺战一次又一次连续暴发。
林则徐战争一败涂地，禁烟令全部取消，割地赔款首现，鸦片毒害依旧，白银外流无阻，勘称处处失败，与国与家毫无贡献，却被某些文人吹捧为中华正眼看世界第一人。当真放屁。
领先半步是天才，领先三步是疯子。林则徐只是领先半步，祸到临头方才发现，所以他成为天才成为先驱。林则徐就没有想过隐忍一两年，充分了解敌人作好准备之后再动手，他不管三七二十一上来就蛮干，用落后的经验对付未知的敌人，焉有不败之理。
林则徐罢官流放后写下“苟利国家生死以，岂因祸福避趋之”的诗句。如果同时代的印度人发下这样的抱负，誓志向英国女皇效忠，中国人一定嘲笑阿三一族奴性入骨天生贱种，落到自己人身上就成为民族英雄。真不知道中国人的是非观是怎么来的！
孙元化在西洋人尚未对中华形成超越的时候就将西洋人当作大敌，大力学习西方科技，大力推广西方科技，尤其是军事科技。林则徐的所作所为只在孙元化他老人家范围之内，不在他老人家范围之外，单凭这一点他老人家就领先同族三百年。在汉人同族眼中只能是一个彻头彻尾的疯子，必须被遗忘，被诅咒，绝对不能成为圣贤。
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