经过一番讨论与酝酿之后，曾纪泽下诏对中央政府革，废原先的六部制，改为内阁制，政府最高行政机构为国务院，下设内务部、财政部、外交部、陆军部、海军部、司法部、教育部、交通部、工商部、农林部、科技部、警备部十二个部门，各设总长一名，副总长两名，分管诸项事务。国务院设国务总理一名，统领国务院诸部，并直接受皇帝之领导。
同时，各地方政府也将仿效中央政府，改府为市，改衙门为政府，地方政府的行政设置，同样仿效中央，但级别要依次下降，如省一级财政部门称为财政厅、市一省称为财政司、县一级称为财政处。
为防止地方政府臃肿庞大，并限制其权力，省市一级将不设外交、陆军、海军三部门，县一级将不设外交、陆军、海军、科技四部门。同时，各级的司法部门将不受本级最高行政长官的领导，直接由中央逐级任免。至于县以下的行政，则暂时推行乡村自治，县长领导的模式。
曾纪泽对政府机构进行大刀阔斧的改革，无非是想尽快营造出一个现代化的国家行政模式，只有这样，才能更好的匹配新一轮的维新变革。
在改组完政府机构之后，曾纪泽马上对经济进行了改革，除了继续推进正在进行的“土地改革”之外，曾纪泽首先对地税进行了改革。
十二月初，大明政府发布了《地税改革条例》定以耕地的法定价格作为全国统一的课税标准；国税的税率定为法定地价的3%另加10％的附加税；地税一律用货币缴纳；法定纳税人是从国家领取土地执照而拥有土地所有权者。
人均十亩及以下者，按以税率收税，十亩以上者，每增加五亩税率递增百分之1％，附加税递增0.33％。
与这项措施时拖出的，但凡愿向政府出售多余土地者，政府将以原先地价的三倍补偿。另外一种方法就是国家以投资贷款的形式收购土地，售出者所得资金，必须用于投资兴办各种新兴洋务商业，并且将获得为期三年的低税待遇。
这两项措施的配套除了扼止并削弱地主的发展，还能鼓励民间资本投向洋务行业，但最重要的是，通过地税改革国家将从富有的地主们手里获得巨额的财富，而这些财富是曾纪泽殖产兴业运动的重要保障。
很快，曾纪泽便通过国务院下达了“殖产兴业”的全国性政策，政府将引导、倡导、鼓励和奖励大明各阶层人士来投资产业，兴办产业。
中央用国家政权的力量，通过各种政策手段和动用国库资金，加紧推行资本原始的积累并以国营军工企业为主导，仿照西方样板力扶植资本主义发展。
为了更明确殖产兴业大政方针，国务院特别制定了诏告全国的第一个“五年计划”
一、逐步废除各地厘金关卡养全国统一市场，交通部将大力建设铁路，发展航运、邮政、电报等交通通讯事业。
二、对原有的工矿军工企业加以改造和扩张形成国有的企业体系，并将大冶矿务局、上海武器制造局等建成所谓的“模范工厂”，以此来激励全国。
三、全方位的引进西方先进技术和设备，并引进各行各业的外国技术人才，对这些外聘人员，要给予高薪待遇，其薪金水平，将不得低于市长级别官员。
四、科技部将奖励、保护、鼓励优质新产品和新发明，尽可能多的邀请外国优秀企业来华举办各种形式的交流会、博览会，以推广他们的先进技术。
五、在农业方面，将引进西方农业技术、农业品种和经营管理制度，尽量使小规模的自耕农，能够在五年之内，使其亩产量增长百分之二十以上。
六、扶持和保护私人财产，促进私人企业发展，各级政府应对民营企业采取保护措施，不得以任何理由打压私人企业。
七、在不排斥外国货的同时，大力宣传奖励国产，鼓励国货出口。对这一方面，国家将重点扶持纺织行业，以及航运业，尽可能在五年的时间内，抢占东南亚百分之三十的市场。
在教育方面，大明将在全国范围内推广中小学义务教育，规定各级政府当年的教育开支，不得低于年度财政支出的百分之七。凡适龄儿童，不分男女，将一律强制性就学，但须根据全地教育水平的差异，逐渐推行，计划在第一个五年计划结束之后，全国的适龄青学率将达到百分之五十左右。
同时责令各省必须开办不低于四所以上的高等学府，以培养国家精英人才，同时应将重点放在师范、职业类学校的建设，尽可能缩短为国家贡献人才的周期。
军事方面，中央政府颁布《征兵令》，建立近代的常备军制度，与此同时建立近代警察制度。以原先的东军训练培养模式为样板，建立大明国防军，进一步引进欧美先进军事制度和建设大量近代军事设施，继续加强与美军方面的军事交流，尽更多的美国军官，能够参与到明军日常的训练当中来。
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