苻丕见邺城难以坚守，最终弃城逃跑。慕容垂占领了邺城后，开始着手重建燕国。太元九年（384年），他在荥阳尊慕容暐为帝，自己则担任大将军、大都督、燕王，代理皇帝处理政务。他以邺城为都城，建立了后燕政权。
慕容暐被苻坚杀害后，慕容垂在中山正式称帝，建立了后燕的统治。称帝后，慕容垂开始了他的开疆拓土之路。他派慕容楷、慕容麟等将领攻打幽州、冀州等地，这些地方的守将纷纷投降。慕容垂很快就收复了前燕的大部分领土。
接着，慕容垂亲自南征，招降了翟辽。翟辽原本是翟斌的侄子，他在翟斌死后，率领一部分叛军继续反抗。慕容垂以强大的军事压力和政治手段，成功地招降了翟辽。然而，翟辽却反复无常，不久后又反叛了后燕。慕容垂大怒，再次率军攻打翟辽。在这场战争中，慕容垂充分展现了他的军事才能和领导风范。他率领大军，一路势如破竹，很快就击败了翟辽。翟辽被迫逃亡，最终死在了途中。
翟辽死后，他的儿子翟钊继承了他的位置，继续与后燕对抗。慕容垂为了彻底消灭翟钊的势力，亲自率军攻打他。在黎阳津之战中，慕容垂采用了巧妙的战术，成功地击败了翟钊。翟钊逃到了太行山，企图凭借天险抵抗后燕的进攻。慕容垂并没有给他喘息的机会，他率领大军继续追击，最终攻克了太行山，彻底消灭了翟钊的势力。
慕容垂在统一了北方的大部分地区后，开始将目光投向了西燕。西燕是由慕容泓、慕容冲等人在关中地区建立的政权，他们与后燕同属鲜卑族，但却相互对立。慕容垂认为，西燕的存在是对后燕的威胁，必须予以消灭。于是，他与众人商议征讨西燕的慕容永。在这场战争中，慕容垂采用了慕容德的计策，先攻打西燕的周边地区，削弱其势力，然后再以伏兵夹击，一举攻克了西燕的都城长子。慕容永被杀，西燕灭亡。
在消灭了西燕后，慕容垂的后燕势力达到了鼎盛。他派慕容农占领了黄河以南的大片土地，使后燕的领土得到了进一步的扩张。慕容垂还亲自前往龙城，祭祀祖庙，表达了他对祖先的敬意和对国家的热爱。在他的统治下，后燕政治稳定，经济繁荣，百姓安居乐业。
四、含恨而终（395 - 396年）
太元二十年（395年），后燕与北魏之间的矛盾日益激化。北魏是由鲜卑族拓跋部建立的政权，在拓跋珪的领导下，北魏逐渐强大起来，开始对后燕的领土虎视眈眈。慕容垂为了维护后燕的利益，执意派太子慕容宝率领八万后燕军攻打北魏。
慕容宝年轻气盛，缺乏实战经验。他在战场上骄傲轻敌，没有充分考虑到北魏的实力和拓跋珪的军事才能。在参合陂之战中，慕容宝的军队遭到了北魏的埋伏，被打得大败。五万士兵被俘后，被拓跋珪残忍地活埋。这场战役的惨败，让后燕元气大伤，也让慕容垂痛心疾首。
慕容垂得知慕容宝战败的消息后，悲愤交加。他决定亲自出征，讨伐北魏，为死去的将士们报仇雪恨。此时的慕容垂，已经年迈体弱，身体状况大不如前。但他为了国家的尊严和荣誉，毅然决然地踏上了征程。
慕容垂率领大军，一路向北进发。他的军队士气高昂，决心要在这场战争中一雪前耻。在平城附近，慕容垂的军队与北魏的军队遭遇。慕容垂亲自指挥战斗，他凭借着丰富的作战经验和卓越的军事才能，成功地击败了北魏的军队。这场胜利，让后燕的军队士气大振，也让慕容垂看到了复仇的希望。
然而，当慕容垂到达参合陂时，眼前的景象让他悲痛欲绝。曾经的战场上，如今堆满了燕军的尸骨，这些都是他的将士，是他的兄弟。他们为了国家，为了荣誉，献出了自己的生命。慕容垂看着这些尸骨，心中的悲痛如汹涌的潮水般将他彻底淹没。他放声大哭，哭声回荡在整个战场上，让人听了心碎。他的身体也因为过度悲痛和劳累，旧疾发作，再也无法前行。
慕容垂知道自己的生命即将走到尽头，他下令全军撤退。在归途中，慕容垂的病情越来越严重。最终，他在沮阳病逝，终年七十一岁。慕容垂的去世，让后燕失去了一位伟大的领袖，也让后燕的命运从此走向了衰落。
五、人物评价
慕容垂的军事才能堪称卓越，他的一生都在战场上度过，历经无数次战役，几乎每一场都打得惊心动魄。他不仅作战勇猛，冲锋陷阵时无人能敌，而且在战略战术上也有着极高的造诣。早期在前燕时，他就凭借着出色的军事指挥，多次带领军队取得胜利，为前燕的扩张立下了汗马功劳。枋头之战中，面对东晋名将桓温的大军，他冷静分析局势，采取了正确的战略，成功地击败了桓温，这场战役更是让他声名远扬。在建立后燕后，他四处征战，开疆拓土，几乎凭借一己之力，将后燕打造成为一个强大的政权。无论是攻打翟辽、翟钊父子，还是消灭西燕，他都展现出了非凡的军事智慧和卓越的领导才能，是十六国时期当之无愧的杰出军事家。
在政治方面，慕容垂同样有着独特的智慧。他深知在复杂的政治环境中如何生存和发展，前期在前燕时，尽管遭受慕容儁、慕容评等人的忌恨和打压，但他始终隐忍不发，等待时机。投奔前秦后，他又巧妙地周旋于苻坚和王猛之间，既赢得了苻坚的信任，又避免了被王猛陷害。建立后燕后，他在施政上采取了一系列措施，缓和了胡汉之间的矛盾，推动了鲜卑族的汉化进程，使得后燕在政治上逐渐走向稳定。他善于用人，
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