很快，作战部队在毕鲁萨鲁多指挥的带领下来到整座增殖都市的控制中心，也就是曾经的机械哥斯拉头部的所在。
增殖都市的控制中心类似客家土楼，整体呈现封闭式的圆筒大楼，外表几乎没有入口存在。毕鲁萨鲁多指挥走到控制中心墙壁的一处显示屏旁边，输入了一连串指令代码。控制中心的银色的封闭金属墙壁如同拼接的积木一样缓缓打开，露出了一个出入口门户。
当他们成功进入控制中心后，昏暗的房间亮起灯光，显示屏启动显示系统处于休眠，同时也显示出来增殖都市的状态。毕鲁萨鲁多指挥立即着手尝试启动曾经的机械哥斯拉控制系统。令人惊喜的是，尽管时间已经过去了两万多年，但控制中心内属于机械哥斯拉的控制程序依然能够正常运行。这无疑给毕鲁萨鲁多指挥带来了一线希望，他迅速解除了控制系统的休眠状态，让其重新投入使用。
时隔两万年之久，这座庞大的增殖都市的控制系统终于迎来了再度启动的时刻。毕鲁萨鲁多指挥在将控制系统开机后，紧接着便进行了全面的系统自检。毕竟，经历了如此漫长的岁月，任何微小的差错都可能导致灾难性的后果。
在这两万年间，曾经的机械哥斯拉经历了惊人的变化。它不再仅仅是一台巨大的机械怪兽，而是通过不断的自我增殖和进化，逐渐演变成了一座以自己的制造基地为蓝本的超级增殖都市。与此同时，其内部的系统程序也发生了多次迭代更新，使得整个系统变得更为复杂和强大。
经过一番紧张的系统更新自检之后，毕鲁萨鲁多指挥终于成功获得了这座增殖都市的完全控制权限。接下来，他毫不犹豫地开始操控着增殖都市，对其进行针对行星哥斯拉的改造升级。他的目标非常明确——要将这座增殖都市打造成一个专门对付行星哥斯拉的强大武器，甚至成为埋葬行星哥斯拉的最终墓地。
随着毕鲁萨鲁多指挥的指令下达，增殖都市的各个部分开始忙碌起来。各种沉寂的先进科技设备纷纷启动，无数机器开始在城市的各个角落忙碌工作。它们有的负责修复受损的建筑结构，有的则专注于改进城市的防御体系。而更多的资源和能量，则被集中到了城市的核心区域，那里正在进行一场前所未有的武器技术革命。
毕鲁萨鲁多指挥计划控制增殖都市建造一个巨大的陷阱困住行星哥斯拉，然后生成四根巨大的电磁脉冲鱼叉，刺进行星哥斯拉体内，让它爆炸，用对付行星哥斯拉亚种的方法对付行星哥斯拉。
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