第二条线路始于明朝天启年间，是从南洋一带进入广东境内，再往北传；
第三条线路则从北方“侵入”——由日本到达朝鲜，再转辽东半岛；
最后一条线路是从俄国传入新疆，这条线路开始的时间稍晚于前三条线路，大约在18世纪下半夜，兴旺于20世纪初。
农史学者大多认为，福建漳州、泉州可能是中国最早引种烟草的地方。明朝万历三年（1575年），福建商人陈振龙于吕宋经商时，最早将烟草带回福建港口月港，于月港附近的石码种植。（注：此陈振龙，即为从吕宋带回红薯之人。）
厉鹗《樊榭山房集》载：“今之烟草，明季出自吕宋国”。
明朝姚旅《露书》记载：“吕宋国出一草曰淡巴菰，一名醺，以火烧一头，以一头向口，烟气从管中入喉，能令人醉，且可辟瘴气。……初漳人自海外携来，莆田也种之，反多于吕宋。”
1614年，烟草从日本传入朝鲜，再传入我国东北地区。
朝鲜孝宗时代的学者李星龄所著《春坡日月录》记载：光海壬戍（1622年），世始用南草（即烟草），南草种从倭（日本）中来，取南方种，我方商于胡中（满洲）取厚利。后商人以生种遗胡，天下通用为资。”
日人恒屋盛服所著《朝鲜开化史》则考证：“满人东征时始知其味，尔来一般流行，嗜好最甚。朝鲜使人赴沈阳时，私之携行，得利益莫大。然为烟草，火灾各处起，以清人焚死多，清帝大怒禁断之。而冒死买卖之迹不绝，一时烟草一握至价百金，银货半岛滥入，云销路大，其价格落。其后商人送种子，满洲地亦产烟草，银货亦随至流入。”
烟草登陆中国后，通过福建、广州、辽宁三个中心向外传播。当时许多医书、方志都记载烟草能“辟瘴”“祛寒”，如明末医生沈李龙的《食物本草会纂》：“烟草，火味，辛温，有毒，治风寒湿痹，滞气停疾，利头目，去百病。解山岚瘴气，塞外边瘴之地，食此最宜。”
明朝张岱在《陶庵梦忆》里讲到烟草普及的迅猛程度：“余少时不识烟草为何物，十年之内，老壮童稚、妇人女子无不吃烟。大街小巷尽摆烟桌，此草妖也。”
明末杨士聪《寒夜丛谈》说：“余儿时见食此者尚少，迨二十年后，男女老少，无不手一管，腰一囊。”
明代名医张介宾所著《景岳全书》中说：“此物自古未闻也，近自我明万历时始出于闽广之间，自后吴楚间皆有种植之矣……由是遍传，而今则西南一方，无分老幼，朝夕不能间矣。”
清初王肱枕《蚓庵琐语》也说：“予儿时尚不识烟为何物，崇祯末三尺童子莫不吃烟矣。”
1637年，崇祯为了禁烟，勒令以斩首示众惩罚私种私售者。兵部尚书洪承畴上奏说“辽东士卒，嗜此若命”，导致禁烟流产，可见当时辽东一带吸烟之盛。直至三百年后的1960年代，东北八大怪中仍有“老婆叼个旱烟袋”一说。
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