其中包括值守紫禁城的亲军三卫八千人，值守皇城的神机营一万两千人，以及值守京畿之地的六万近卫军将士，还有那四十万九边将士。
在一年多前，在居庸关和居庸关外的宣大地区经过了几番大战的近卫军第一镇、第二镇，各自都损失了数千士卒。
其中第一镇在居庸关和居庸关外损失的较少，总计两千余人。
第二镇在紫荆关上损失了不少，出了紫荆关后，又在桑干河畔遭遇莽古尔泰的正蓝旗大军围攻，损失较大，几乎损失了接近一半，最后统计下来超过了六千之数。
近卫军第一镇、第二镇，是如今这位崇祯皇帝花费了大量的精力财力编练的第一支、第二支新军，从来都是当作自己核心的力量之一来看待。
因此，在遭受了这样的损失之后，近卫军第一镇与第二镇，于崇祯三年里，相继撤回到了各自的驻地休整补充。
一方面崇祯皇帝需要他们驻扎在京师的南北，发挥稳定京畿与震慑朝堂的作用，为崇祯三年的一系列改革做后盾。
另一方面，也是这两镇近卫军的损失需要尽快地得到补充。
而近卫军第一镇都统制使出身的近卫军都督府左都督马世龙，以及近卫军第二镇都统制使出身的后备军都督府左都督王辅，也都在新官上任之后，立刻将涿州新军训练大营里训练出来的新兵，优先补充给了近卫军第一镇和第二镇。
类似这样的事情，根本不需要崇祯皇帝明发旨意来指点，马世龙与王辅这两个人自己就会下大力去做了。
到了崇祯三年的十月，驻守通州的近卫军第一镇，特别是损失较大的驻守保定的近卫军第二镇，再一次实现了齐装满员，重新达到了《皇明近卫军编制条例》的要求，即，将校士卒满编一万五千员。
近卫军第一镇、第二镇与建虏的那场激战，以及各自在战争中的损失，让马世龙和王辅对于近卫军这种冷热兵器混编的新军队伍，都有了更进一步的认识。
原本就是由马世龙主持编撰的《皇明近卫军编制条例》，在他出任了近卫军都督府左都督之后，第一时间内就报请崇祯皇帝，进行了大幅度的修订。
其中各标、各营、各队、各哨之中士卒该有多少，战马与驮马该有几匹，火枪该有多少杆，火炮该有多少门，辎重大车该有多少辆，将校官佐该有多少员、参谋训导又该配几个，全部都规定得一清二楚。
崇祯一式前装燧发滑膛枪，历经三年的作战，经受住了检验，也得到了近卫军诸镇将领们的信任。
因此，在新修订的近卫军编制条例之中，轻装火枪手大幅度增加，身披铁甲行动迟缓的刀盾手大幅度减少，而野外防御骑兵冲击的长枪手，则基本保持地位不变。
至于近卫军原有编制中成建制存在的弓箭手，则被彻底淘汰，他们原有的建制被训练整编为了一个全新的兵种——掷弹兵。
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