不久之后，九脑人军团得到指示，允许使用规则武器还击！
得到指令的第一时间，九脑人文明便对巨神人使用了规则武器反击。
然而，作为首先动用规则武器的一方，巨神人早有防备， 用防御性规则武器抵消了九脑人的规则攻击，然后发动了第二次规则攻击，摧毁了一个九脑人边境军团。
九脑文明不甘示弱，接二连三发动规则武器。
规则武器战争很快进入白热化，你来我往，双方互有胜负。
不过，到此时，两个文明尚且保持克制，只动用了一级规则武器。
但是，巨神文明有着领航者的能量基站支持，根本不用节省消耗。
在火力碾压的情况下，很快就占据了上风，将九脑文明打得节节败退。
在丢失了一整座超星系团之后，九脑文明终于坐不住了。
一名战线总指挥，在没有接到指令的情况下，动用了三级规则武器。
一击之威，直接将一座超星系团毁灭。
巨神人在吃亏之后，很快反应过来，搬出了更高级的规则武器。
双方的常规战争，就此演变成了规则武器对轰。
这场战争持续了数千年。
据不完全统计，巨神文明损失了七支战线级边境军团，泯灭的超星系团82座。
而九脑人文明损失十一支战线级边境军团，泯灭的超星系团达到了149座！
从数据上来看，毫无疑问是巨神文明大获全胜。
然而，作为胜利的一方，巨神文明并没有从九脑人那里得到任何东西，反而消耗了一部分文明底蕴。
当然，九脑文明更惨，已经可以说是伤筋动骨了。
好在，双方文明的最高权力机构紧急会谈，阻止了这场战争，不然结果难以预料。
在这期间，巨神文明为了获取更多的资源，与领航者展开了更加深入的合作。
其境内一半疆域建设了领航者的能量基站，为了让领航者加快建设进度，还主动提高了出资比例，降低了完工后的分成比例。
对于领航者和巨神文明的合作，九脑人心知肚明。
直到战争陷入被动，九脑人议会才发现，领航者的投资有多重要。
战争结束后，九脑人立即派遣了使者，与领航者进行了接洽，主动降低己方要求，用比巨神人还丰厚的条件，吸引领航者投资建设能量基站。
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