戊寅日（初四），皇上晓谕诸将：“军队是用来平息暴乱的，不是制造暴乱的。若借军队逞私欲，是仁者不为的。过去元末战乱，群雄角逐，倚仗武力欺凌的何止一人？其中有因贪财而凶残的，有因好色而淫暴的，有因私仇而报复的，有因愤怒而滥杀的。率军作战，只求一时快意，却不知伤人害物，荼毒生灵。朕每每行军作战，必申明号令，约束贪暴。你们从事征讨，应体会此意。像曹彬（仁将）、曹翰（暴将）的事例，足以为戒。我曾以此告诫徐达，为将之道，虽重威严，但根本在于得士卒爱戴。徐达能听我言，攻城略地，不滥杀无辜，可称良将。你们应努力效仿。”
庚辰日（初六），命指挥华云龙调取海州驻军，军队抵达后，又下令召回。
甲申日（初九），丞相李善长等人劝朱元璋即皇帝位，朱元璋没有同意。
李善长等人极力请求说：“殿下从濠梁起兵，没有尺寸土地作根基，就成就了大业。四方群雄几乎削平殆尽，远近之人无不归心。这确实是天命所归，希望您早日登上帝位，以慰藉臣民的期望。”朱元璋说：“我考虑自己功业尚未遍及天下，德行尚未使万民信服，天下统一的形势尚未形成，四方道路尚不通畅。如果仓促称帝，恐难服众。自古帝王拥有天下，即使明知天命已归，人心所向，尚且谦让不敢当，等待有德者（其实是指自己时机成熟）。我常笑陈友谅刚得一隅之地，就妄自称尊，志骄意满，终致灭亡，为后世所讥笑。我岂能再蹈他的覆辙？若天命在我，自有水到渠成之时，不必急于求成。”
乙酉日（初十），思南道宣慰使司都元帅田仁智派五寨副长官戴允中进献表章，贡奉马匹和地方特产。
己丑日（十四），雷电击中宫门上的兽吻装饰物，得到一件形似斧头的石质器物。朱元璋命人将其收藏起来，出行时派人背负在御驾前；临朝听政时则将其放置在几案上，以示敬畏上天的警示。于是下令赦免朝廷内外的囚犯。
庚寅日（十五），设置徐州卫和济南卫。方国珍当初投降时，约定杭州城被攻克后，就献出土地归顺朝廷。
等到朝廷大军攻克杭州，方国珍依然占据着自己的地盘，时常派遣间谍窥探我方虚实，又联络福建（的陈友定），企图形成掎角之势。朱元璋闻讯大怒，派使者责令方国珍缴纳贡粮二十三万石，并写信晓谕道：“你当初归降，声称杭州城破即献土来归，这是你左右之人共保富贵的良策。岂料你心怀奸诈，阳奉阴违，屡次愚弄于我。张士诚与你接壤，攻取你很容易，他之所以不敢加兵于你，全因我能牵制他，你才能安居海隅，坐享三郡之富，这是我给你的大恩庇佑。你却不自珍重，背信弃义，时常派奸细窥探我方动静，暗中勾结陈友定，图谋互相支援。他（陈友定）自救尚且不暇，岂能救你？你为何如此糊涂！今明确告知于你：我军攻下姑苏（苏州）后，即挥师南下取温州、台州、庆元（宁波），水陆并进，无人能挡。你趁此时机，改过归顺，恪守以小事大之义，尚可保富贵传子孙及下属。如若不然，集结三郡之兵与我一决胜负，也算大丈夫所为。再不，则舍弃三郡之民，扬帆入海苟且偷生。但我担心你的子女玉帛反成拖累，舟中自生内乱，徒为天下豪杰耻笑。额外的恩宠不会常有，你应慎重思量！”书信送达，方国珍大为恐惧，召集弟侄及将领谋士商议对策。其郎中张本仁说：“江东军队正围攻姑苏，姑苏（张士诚）是劲敌，国富兵强，城高池深，怀必死之志，胜负难料。他们怎能轻易跨越千里来攻打我们？”刘庸说：“江东军队多步骑，步骑利于平地，在我海滨之地，能奈我海船何？”方国珍的弟侄多赞同此见。唯有丘楠争辩道：“此二策皆非保全主公之福！唯有智慧能决断大事，唯有诚信能守护国家，唯有正直能指挥军队。一旦江东攻克姑苏，挥师南下，乘胜进军，责问我背叛之罪，师出有名，军威正盛，我孤立无援，必将一败涂地！不如遣使奉书，表明不敢背德，或可平息干戈，使公常保富贵，福泽子孙。否则，大祸临头！”方国珍素来愚昧不明，不能决断，只是日夜搬运珍宝，聚集巨舰，准备渡海逃亡。
辛丑日（二十六），设置太常司、司农司、大理司、将作司四司，均为正三品衙门。每司设卿（正三品）、少卿（正四品）、丞（正五品）。太常司下设典簿、协律郎（正七品）、博士（正七品）、赞礼郎（从八品）。司农司下设庸田署令（正五品）、典簿、司计（正七品）。大理司下设评事（正七品）。将作司下设左右提举（正六品）、同提举（从六品）、司程、典簿、副提举（正七品）、军需库大使（从八品）、副使（正九品）。任命杨思义为司农卿，刘诚、杭琪为司农少卿，单安仁为将作司卿。
本月（七月），朱元璋告谕群臣：“古代的贤君常忧虑如何治国，古代的贤臣也常忧虑如何辅佐君主。贤臣为君主分忧，君主常得安宁；明主为国事忧虑，天下常得太平。如今疆土日益广阔，百姓日益增多，而我心中未尝一日忘却忧虑，为何？实在是因为久经困苦的百姓尚未完全复苏休养，安抚他们的方法尚未尽善尽美。卿等能与我同忧吗？若能与我同忧，或许能感动上天之心，使祥和之气降临。如果只是尸位素餐，贪图俸禄，对百姓疾苦漠不关心，最终祸败临头，将不可挽救。能不戒惧吗！”
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