设置尚宝司，设卿一人（正五品），少卿一人（从五品），丞一人（正六品）。设置侍仪司（从五品），设侍仪引进使。设置教坊司（正九品），掌管宴会音乐，由乐工担任，设大使、副使各一人，和声郎二人。命令设置内职六尚局。
方国珍派遣儿子方明完奉表谢罪请求投降，表文说：“臣听说上天无所不覆，大地无所不载。王者体察上天效法大地，对人无所不容。臣长久以来蒙受陛下覆载之恩，不敢自绝于天地，因此陈述愚衷，相信陛下必有包容臣之处。臣本是庸才，昧于学问，遭逢乱世多故，起兵于海岛，并无父兄势力可倚仗，与众豪杰角逐，也并非有图谋大业的野心，不过是想找到像商汤、周武王那样的明君，作为依附罢了。先前王师渡江，势如雷霆，直抵婺城，远近震惊，因此臣派儿子拜见将军，归心效顺。那时就已预知陛下必有今日，所以想依附陛下的光辉，企盼些许恩泽。而陛下推诚布公，赐手书让质子回归，命臣守卫城邑，如同钱镠旧例。臣遵奉约束，不敢违抗。岂料侄子明善不加戒备，擅自挑起事端，罪孽深重，实难开脱。如今守城将领飞书急报，说天兵远来，臣闻之惊骇失措，惶恐不安，于是让守军迎接王师，然而自己还是不免浮海逃避，这是为何？从前孝子侍奉父母，遇到用小棍责打就承受，用大棍责打就逃走，臣的情况正与此类似。臣私下自责，这十多年间，若非陛下，臣不会有今日。一旦失足，天下后世必有议论臣者。臣冒死遣子入侍。伏望陛下施以保全养育之恩，再赐臣再生之德，允许臣归乡终老，使子侄辈得以保全余生，听候驱策，实为臣万幸。”太祖起初恼怒他反复无常，览表后心生怜悯，赐书说：“先前你外示归诚，内怀奸诈，我姑且容忍，待你自效。岂料你玩弄小智，愈加肆行奸恶，竟背弃前盟，致劳我师。你还不立即束手归降，竟逃于海上，还想观望成败。如今势穷来归，言辞哀切恳挚。我将以你此诚为诚，不追究你以前过错。你勿要自疑，率众来归，一概从宽赦免。”
戊申（初六）：宋迪出使山东返回，对太祖说：“都督同知张兴祖攻克山东诸郡，缴获兵马数以万计。兴祖能推诚待人，降将中有可用之才的，就让他们统领旧部，一起进取。”太祖说：“这不是好办法。听说兴祖麾下降将，甚至有统领千名骑兵的。一旦临敌，若其兵力不足以与敌抗衡，因此生变，如何控制？”于是命宋迪再往传谕张兴祖：“如今所得降将及官吏儒生，凡有才能可用的，全部送来京师，不得擅自留用。”
大将军徐达等到达章丘，元朝守将右丞王成投降。太祖梦见有人将玉璧放在自己脖子上，不久颈后肉微微隆起隐痛，怀疑是病，用药敷抹无效，后来竟长成骨头，高高隆起，十分奇异。
己酉（初九）：徐达到达济南。元朝平章忽林台、詹同（脱因帖木儿）闻讯，先驱使百姓，然后率军逃走。平章朵儿只（达朵儿只进巴）等献城投降。明军收编将士二千八百五十五人，马四百二十九匹，命指挥陈胜镇守济南。后来朝廷遣送朵儿只等赴建康，行至洛口，朵儿只等杀死使者，向北逃走。征南将军胡廷瑞到达建昌，元朝武元将军李宗茂献城投降，明军获将士五千四百六十余人，马一百二十九匹，粮六万七千余石。
庚戌（初十）：都督同知张兴祖率兵攻取济宁，元朝平章陈秉直弃城逃跑，明军入城驻守。
辛亥（十一日）：太祖派人谕令大将军徐达、副将军常遇春：“闻将军已平定齐、鲁诸郡，朝野同庆。我独以为，胜利后能警戒者方可常胜，安定时能警惕者方能长安。警戒者虽胜如同初战，警惕者虽安如同履险。屡胜之兵易骄，久劳之师易溃。能虑及失败，方可避免失败；能谨慎于成功，方可保有成功。必须周密防范，谨慎严密，常如临敌。若忽生懈怠，必为敌所乘。慎之！慎之！”密州守将邵礼到徐达军前投降。
方国珍及其弟方国珉率部众到汤和军门拜见投降。明军收得其步卒九千二百人，水军一万四千三百人，官吏六百五十人，马一百九十匹，海船四百二十艘，粮十五万一千九百石，其他物资也相当。接着，元朝昌国州达鲁花赤（掌印官）阔里吉思也来投降，获粮六万九千石，马五十匹，船四百八十二艘。明军将方国珍等押送京师。当初，方国珍投降并非本意，故屡次反复。虽表面归顺纳质，但仍与元朝往来如故。元朝也依赖其海运之力，屡次加封方国珍为太尉、江浙行省左丞相，赐爵衢国公；其弟方国璋为行枢密副使，方国瑛、方国珉及胡善等皆累官至行省平章政事。蒋英、刘震叛乱时，欲经台州逃往福建，方国璋在仙居与之交战，兵败被杀。
壬子（十二日）：乐安俞胜派郎中刘启宗、理问张秉一到徐达军前请降。
癸丑（十三日）：中书省左相国、宣国公李善长率领文武百官奉表劝太祖即皇帝位，表文说：“开创基业，既已拓展盛世疆土；顺应天命人心，理当正式登临帝位。苍生仰望，如红日方升。臣闻以道化民者称为皇，以德教民者称为帝。唯有德才超群，方能光大建立鸿名。由此继承百王而建立国家，安定四海而总揽纲纪。此等盛事闻于往昔，今逢其时适遇明主。臣等恭敬思惟殿下勇智天成，聪明绝世，扫除天下风尘，拯救万民于水火。率水师西上，伪汉幼主奉玺出降；命将军东征，伪吴国主束身归俘。于是天下归心，如江汉朝宗大海；国家肇兴，似金汤坚固永固。既已身受天命，必当君临天下。上可答天心，下可符民望。恳请俯从众请，早定尊号。臣李善长等合聚群情，亲伸劝进，在圣明朝廷前恭敬下拜，辅佐圣主如龙腾飞。发政施仁，助天地化育万物；制礼作乐，开万世太平基业。谨奉表劝进以闻。”太祖说：“当初我即吴王位，也是不得已勉强听从众人之言。如今你们又劝我即帝位，我恐德薄，不足以担当。”群臣皆叩头请求道：“天生圣哲，本为百姓。殿下即王位，天命已有归属。今又过了三四年，若不正大位，何以慰天下臣民之望？昔汉高祖诛灭项羽后，群下劝进，他也不违众请。今殿下除暴乱，救生民，功勋充塞宇宙，德行合乎天心。天命所在，诚不可违。臣等敢冒死恳请。”太祖坚决推辞。
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