以待研究的植物DNA为模板，用合成的引物进行PCR扩增反应
高浓度琼脂糖凝胶、非变性或变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测其多态性
如何将一个RAPD或SSR分析产生的片段转化成SCAR（序列特异扩增区域）标记？
（1）对基因组DNA作RAPD分析后，将目标RAPD片段进行克隆并对其末端测序
（2）根据RAPD片段两端序列设计特定引物（18～24bp），一般引物前10个碱基应包括原来的RAPD扩增所用的引物
（3）以合成引物对基因组DNA进行PCR特异扩增
9、酶切扩增多态性序列（CAPS）是如何产生的？进行CAPS分析的基本程序是什么？
将PCR-扩增的DNA片段用限制性内切核酸酶切割，凝胶电泳分离酶切片段，从而得到限制
性片段长度多态性
程序：（1）利用特定引物进行PCR扩增
（2）将PCR扩增产物用限制性内切核酸酶酶切
（3）琼脂糖凝胶电泳将酶切产物DNA片段分开
（4）溴化乙锭（EB）染色，观察片段长度多态性
10、何为单核苷酸多态性（SNP）？SNP的来源有哪些？与其他分子标记相比，SNP有何特点？
概念：指不同个体基因组DNA序列之间单个核苷酸的变异。它又被称为第三代新型多态性标记
SNP的来源：单碱基的转换、颠换以及单碱基的插入缺失
特点：（1）双等位型标记:单碱基替换包括：1个转换：CT（GA）和3个颠换CA（GT）、CG（GC）、AT（TA）（括号中是互补链，斜杠的左右表示同源染色体）
（2）在DNA分子分布不均匀：多在CpG甲基化位点发生CT转换
（3）密度高，多态性极其丰富。在人类基因组中，每1.3kb就有一个SNP。
（4）具有遗传稳定性基于单核苷酸的突变，突变率为10-9，与SSR多态性相比，具有更高的遗传稳定性
（5）SNPs的检测和分析易实现自动化。如应用DNA芯片技术，可实现大规模、自动化分析检测
11、简述构建遗传图谱的依据。
同源染色体减数分裂过程中会发生交换，交换的结果便使染色体上的基因发生重组，两个基因之间发生重组的频率取决于它们之间的相对距离。因此，只要准确地估计出交换值，进而确定基因在染色体上的相对位置就可绘制连锁遗传图
分子遗传图谱构建的包括哪些主要环节？
（1）选择适合绘图的分子标记，根据遗传材料之间的多态性确定亲本组合
（2）建立作图群体，即具有大量分子标记处于分离状态的分离群体或衍生系
（3）群体中不同植株或品系的标记基因型的分析
（4）利用计算机程序建立标记之间的连锁关系
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