努尔哈赤将叶赫部分化编入八旗，以削弱他们的力量，又将金台石、布扬古的家眷籍没为奴，从此，仇恨的种子深深的植入了叶赫那拉氏家族中。
努尔哈赤统一女真，实力大增，户增五万，兵增三万，至此，努尔哈赤拥兵十万以上，成为辽东最强大的军事力量。
大金国的主要对手—大明王朝，阻碍金国扩张的力量，一个让努尔哈赤无比愤恨的王朝，他要向狮子般将这个王朝撕碎。
一方在紧张的修兵备战，一方在加紧修筑城堡，训练新兵。新的大战即将拉开帷幕！
经过一个多月的路途，孙承宗终于到达了沈阳。孙承宗身体不好，一路上停停顿顿，边休养边赶路，到了沈阳，整个人廋了一圈。
见到老师的到来，朱由校激动不已，让贺耿和江明休息两天去熊廷弼那报到，训练新兵去了。孙承宗和朱由校促膝长谈，这一谈，不知不觉谈到深夜，朱由校将来到辽东后的事向他叙说了一遍，又将以后的想法也陈述了出来。孙承宗也将一路上的所见所闻一一陈述，沿途逃往关内的百姓拖家带口，甚是惨状，有些地方官员还趁机敲诈勒索，卖儿卖女不在少数。听到这些，朱由校感慨万千，『乱』世之中，暴苛之政比起女真之患尤甚。
他们二人先是陷入一阵莫名的悲伤之中，转而，孙承宗抬头，眉目微皱，道：“殿下，此次经过锦州、宁远，发现此处乃是咽喉要道，若能在宁远之侧筑起两处城堡，形成犄角互援策应，便可成为山海关外一道坚固的防线，与前方开原、抚顺、广宁等第一道防线遥相呼应，更可巩固辽东。”
朱由校听到孙承宗说这些，来了精神，咧开嘴笑道：“师傅果然大才，出一次关还不忘考察地形，你说的不错，将来辽东经营少不了师傅费心！”
这就是历史上着名的“宁锦防线”，想不到这个时候已经有了初步规划。
自此，辽东局势逐渐稳定，朱由校将孙承宗引荐与熊廷弼，让他辅佐熊廷弼。熊廷弼起初不高兴，认为皇长孙不断安『插』亲信在他周围，极易被人掣肘，因是皇长孙的老师，也是日后的帝师，极有可能成为日后的内阁首辅，熊廷弼不敢怠慢，只得忍气吞声将就。谁知日后在处理辽东事务和治辽之策上竟然与孙承宗有惊人的相似，且孙承宗谈吐和战略眼光也独到一处，令熊廷弼刮目相看，如遇知音一般，尽弃嫌隙，与孙承宗共同参知辽事。
努尔哈赤看到明军练兵筑城，防线大固，便经常率兵袭扰，但明军凭坚城防守，拒不出城迎战，努尔哈赤也无可奈何，始终无法再前进一步。
努尔哈赤虽然在萨尔浒大战中获胜，又攻灭叶赫，统一女真，实力大增，但辽东守备也大固，从北面的开原到南边的清河，形成了一条长达300多公里的坚固防线，使得大金国无法向前挺进一步。努尔哈赤善攻，长于野战，而熊廷弼善守，凭坚固城池不出城门一步，让努尔哈赤奈何不得。
努尔哈赤正踌躇不展之际，忽一密探来报，努尔哈赤以为明朝那又有什么大的动向，急唤到一旁垂询。密探回奏：“奴才在沈阳探得，明朝皇太孙亲临辽东坐镇！”
努尔哈赤略显吃惊，眉头一挑，悠然道：“噢，明朝的皇太孙坐镇辽东？他多大？”
“奴才探得，今年刚满十六岁。”
努尔哈赤一脸不屑，笑道：”一个『乳』臭未干的小子不在皇宫里养尊处优，也敢来这里，明朝的皇帝当真不喜欢太子一系，哈哈……”
“奴才听到明朝的皇太孙不是一般人物，虽年少，但异常聪慧，民间多有他的传闻。”
“哦”，努尔哈赤止住笑容，收敛起来，“怎讲？”
“奴才听闻，明朝皇太孙天纵英才，聪慧异常，曾多次言及辽东之事，听说熊廷弼能担任辽东经略便是他的举荐。明军大举进攻我大金时，他已洞悉战局，便偷偷跑出皇宫来到辽东。时值大汗刚灭萨尔浒山明军，明朝皇太孙刚到沈阳，便不管其他几路明军，直奔南路李如柏部。”密探略一抬头，字字珠玑说道：“鸦鹘关外一战，听闻便是皇太孙指挥！”
努尔哈赤听到这，大惊失『色』，直感血流上涌，登时便坐不住，猛然站起，惊道：“你是说鸦鹘关外我与明军之战不是李如柏，而是皇太孙！”
密探深深鞠躬，道：“是！”
那一场夜战，让努尔哈赤记忆犹新，甚至不敢回忆，那场不是惨败的战败，让他第一次感到了羞辱！原以为是败在了老相识李如柏手上，却不曾想竟是一个『乳』臭未干的『毛』孩子！这是很可怕的！努尔哈赤知道这意味着什么，一个能干的储君要远比一个能干的大臣可怕！这可是未来主宰大明的人！
努尔哈赤僵愣在御座前，一脸凝重，眼神呆滞的看向前方……
他知道，自己的路越来越难走，这将是一个可怕的对手……
这时，范文程带着奏表小心翼翼的刚走过大殿门槛，看到大汗在呆滞的看向门口，又见一个汉人模样打扮的人跪在御座前，心里猜到了八九分，一定是明朝方向有什么事在密报给大汗。范文程不敢打扰，转身要走，忽听大汗喊道：“是范师傅吗？请进来吧！”
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