“除了军队编制、官职名称与品级，以及对应的构成与兵员数量外，禁军的勋章等级、名称与奖励方式依然沿用忠勇、英勇、武勇三类九等。
此外，禁军将启用新的军阶，用以区隔职位与品级高低，从上至下分别是正一品的上柱国、从一品的柱国、正二品的镇国将军、从二品的镇武将军、正三品的镇宁将军、从三品的镇远将军、正四品的忠节都尉、从四品的忠毅都尉、正五品的忠勇都尉、从五品的武节校尉、正六品的武毅校尉与从六品的武勇校尉。
军阶对应的官职名称分别为大都督、左右都督、都督或总兵、同知或副将、佥事或参将、副参将、经历或游击、副游击、千长、副千长或司长、副司长或连长。
在都督府有了新的军阶后，原先的十二阶武勋只作为恩荫使用，而三十阶武散阶与武谥号一起只作为追赠使用。
此外，都督府不再授予世袭锦衣卫、禁军与卫所的实职，所有恩荫的武将子弟不管十二阶武勋品级有多高，都必须先去西山武学接受正规学习，再根据毕业时的实际考核结果授予具体的军阶与官职。
有了西山武学选拔军官后，隆武五年的武举正式废止！
至于武勋勋爵，将依然秉承太祖制定的‘凡爵非社稷军功不得封,封号非特旨不得与’原则，不可轻易授予。
至于宗室、外戚爵位，宗室保持不变，外戚的爵位除了侯伯与驸马都尉外，将不再授予五军都督府或五城兵马司的职位，而是使用恩荫的十二阶武勋，不能担任内阁与六部九卿的实职，亦不能担任都督府与即将成立的镇边府、保安府三品以上的实职！”
“启奏陛下，臣已经将都督府的军制变革之事汇报完了，请陛下示下！”曹化淳说完之后，朝朱由校深深行了一礼。
“嗯，先候着吧！”朱由校点点后，朝其他人扫了一眼后问道：“诸位爱卿可有什么疑义？”
兵部尚书熊廷弼率先站出来提出了他的疑义：“启奏陛下，若隆武五年废除了武举，都督府之外的军官来源是否也要从西山武学挑选？”
这个问题徐光启本想提问的，但却被熊廷弼抢了先。
“这的确是个问题，现在兵部的武学早就荒废得不成样了，从那选将只会耽误朝廷军队大事。”
朱由校皱了下眉头后，再次开口道：“这样吧，废除现在的武学，兵部成立一个类似于西山武学的直属武学，就叫京师武学吧，院址的话，兵部去平谷选块两千亩左右的地，但不可强制征收，优先挑选贫瘠的土地！”
“是，陛下，不知京师武学的品级与祭酒人选如何定？”熊廷弼继续问道，这种事情只能皇帝来定。
朱由校沉吟了片刻后说道：“跟西山武学一样，祭酒正三品，副祭酒从三品，分成正四品的步兵、骑兵与水兵分院，祭酒只能由朕担任，共设两个副祭酒。
负责教学内容的副祭酒暂时由戚金兼任，而负责武学日常庶务的副祭酒由兵部侍郎王之臣担任，分院院正、监正、司业、教官与助教由两位副祭酒商议，再最终交给兵部尚书与朕决议！”
“两位副院正，该由谁为尊？”熊廷弼确认了一遍。
朱由校只是短暂地停顿了片刻后，便做出了他认为合适的决断：“武学是训练军官之摇篮，必须由作战经验丰富的退伍或半退伍老将为主导，所以以负责教学内容为尊！”
“启奏陛下，大宁伯现在担任着京营右提督，同时还是都督府的同知，是否会无暇顾及京师武学？”方从哲不疾不徐地询问道。
方从哲的话，朱由校自然明白是什么意思，无外乎劝他继续以文御武，这样做的确避免了武将做大的可能，但也会造成整个大明重文轻武，最终导致军队战力急剧下滑。
朱由校看向站在武将最末尾的戚金，装做不疾不徐地询问道：“大宁伯，你认为你自己是否有足够的精力顾及京师武学？”
戚金站出来行了一礼后，大声答道：“回陛下，臣就算不眠不休，也要替陛下将京师武学管好！”
看着气势十足的戚金，朱由校笑眯眯得看向方从哲：“元辅，可还有问题？”
“回陛下，戚老将军勇猛，是老臣多虑了！”方从哲尴尬地回道，回的时候还故意将“老”字提高了两个分贝。
“那就这么定了！”
朱由校对于方从哲的小心思视而不见听而不闻，任然是笑眯眯地看向戚金：“现在平谷那边恐怕已经冻上了，年前只用选好位置，明年开春后再动工即可，争取一年后能够开展教学。
同时在年前和王之臣确定好监正、三个分院及其它武学官员与教官人选，若一时找不到合适的人选，就去西山武学、边军或禁军里面挖人！”
“是，陛下，臣明白了！”戚金答道。
“化淳，当初西山武学初创加上后面扩建，大概花了多少钱？”朱由校看向曹化询问道，必须要当场将建造预算确定下来，免得兵部的人瞎报。
曹化淳简单回忆了一番后，才出声答道：“回陛下，初创的时候比较简陋，而且面积也不大，大概只花了不到两万两银子，这个徐阁老应该还记得。
西山武学后面又进行了三次扩建，加上买地，前后大概一共花了十五万两银子左右，不算之前禁军第九营的营地，总面积达到了三千亩！”
“熊爱卿，可听到了？”朱由校轻点了下头后，看向了熊廷弼。
“回陛下，臣回去后，便向户部申请十二万两的建校预算！”熊廷弼参照曹化淳的花费描述与自己亲身参观过西山武学的经历，预估了一个比较合适的预算。
朱由校看向一直未开口说话的李长庚：“李阁老，可要与毕爱卿嘱咐好此事，不可耽误了京师武学的进度！”
“是，陛下，臣遵旨！”
李长庚见事情已经不可逆，便只好选择了遵从，虽然是由戚金这个武将主导京师武学，但日常庶务管理还是掌握在兵部的手上，捏紧了钱粮，不怕武将们不会乖乖听话。
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