对于那些提出反对意见的人，明成祖全部革职查办。一万年太久，只争朝夕。他没时间也没耐心，像当年北魏孝文帝一样慢慢耗。
第二年，北京紫禁城正式动工兴建。新建成的北平城周长四十五里，规制方正。明成祖下诏正式迁都，以北平顺天府为京师。而以南京应天府为留都，仍保留南京六部。
公元1421年正月，明成祖登临北平奉天殿，会见百官，大祀南郊，迁都大政至此基本完成。
关于定都北京，在有明一代尚有反复。
明仁宗为太子时，长期在南京监国，对这里更有感情，他即位后下令修葺南京宫殿，并称北平为行在，事实上废除了北平的京师地位。但他只当了不到一年皇帝就驾崩，未能如愿还都南京。明英宗继位后，正式确定北平的国都地位，不再称行在。
永乐迁都后，汉人政权对华北地区的控制达到前所未有的高度。
北京从此成为全国的政治、经济、军事、文化中心。经过代代修缮、保留至今的北京故宫紫禁城，以一条中轴线贯穿南北，左右对称，富丽堂皇，成为中国封建社会建筑史上的不朽杰作。其规制便由永乐时期奠定。
在北京朝阳区东坝一带，至今还有许多与明成祖朱棣有关的地名，如马厂、马房、驹子房、行宫庙等等。这是因为东坝地区当年水草丰美，适合牧养马匹，一度被建设成为御马苑。
而早在公元1404年，明成祖已在天津筑城，设天津卫。所谓天津，意谓“天子经由之渡口”。明代嘉靖年间所立之《修建三官庙碑》，记载了天津赐名、筑城、设卫的经过。
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