户部设正二品尚书1人、正三品左右侍郎2人、正五品郎中23人、从五品员外郎3人、正六品主事24人，分管13省的13个清吏司以及宝钞提举司、广盈库、军储仓等。七品以下56人，共109人。
户部掌管全国疆土、田地 、户籍、赋税、俸饷及一切财政事宜。办理政务按地区分工而设司。各司除掌核本省钱粮外，亦兼管其他衙门的部分庶务，职责多有交叉。
礼部设正二品尚书1人、正三品左右侍郎2人、正五品郎中4人、从五品员外郎1人、正六品主事4人分管仪制、祀祭、主客、精膳四个清吏司以及铸印局等，七品以下5人，共17人。
礼部分掌管礼仪、祭祀、宴飨、贡举以及日常官员行为规范、礼仪礼节、公章管理、荣誉称号、庆典活动组织、庆功宴安排等事务性工作。
其中礼仪、宴飨中包含外交工作。古代汉族礼仪，以祭祀之事为吉礼，丧葬之事为凶礼，军旅之事为军礼，宾客之事为宾礼，冠婚之事为嘉礼，合称五礼。
兵部设正二品尚书1人、正三品左右侍郎2人、正五品郎中7人，从五品员外郎4人、正六品主事12人，分管武选、职方、车驾、武库四个清吏司以及会文馆等。七品以下7人，共33人。
兵部掌管武官选拔、考核、任命以及军制、训练、征调、镇戍、边防、仪仗、禁卫、驿传、厩牧、军械、符勘、兵籍、武学等军事行政，其堂官往往督军出征，掌管军队进退、赏罚，职权尤重。相当于21世纪的国防部。
刑部设正二品尚书1人、正三品侍郎2人、正五品郎中13人，从五品员外郎1人、正六品主事17人，分管13省13个清吏司。七品以下9人，共43人。
刑部掌管立法审定、刑狱。复核各地的刑案以及直接审理京畿地区的案件。
工部设正二品尚书1人、正三品左右侍郎2人、正五品郎中8人，从五品员外郎6人、正六品主事13人，分管营缮、虞衡、都水、屯田四个清吏司以及宝源局、军器局等，虞衡是掌官山林川泽，都水是负责水利设施修护。七品以下32人，共62人。
工部掌管全国工程事务，负责全国的桥梁、宫殿、大堤、水利等大型土木工程的营建，也管理部分开矿、冶炼。
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