面对无声蔓延的“尼人化”瘟疫，传承千年的忍者大村自然不会坐以待毙。根植于血脉中的战斗本能与对自身力量的自信，让他们在初期选择了最直接的方式——反击。当然了，如果这个时候忍者团体成了缩头乌龟，忍界的秩序肯定就会立刻崩塌了。
由精英上忍带领的小队开始频繁出击，主动清剿在村庄外围游荡的“播种者”小队。战斗本身往往毫无悬念。晓的这些播种者，大多是由被转化的中忍、特别上忍组成，或许力量稍有提升，但战斗技巧和战术思维远不如真正的精英。木叶的柔拳、云隐的雷遁、岩隐的土遁……纷纷将这些小队击溃。
然而，这恰恰落入了长门的算计。
一次典型的围剿战后，一支木叶小队正在检查尸体。一名日向分家的成员开启白眼，谨慎地扫描着：“队长，确认目标全部清除，查克拉反应消失。”
“很好，收拾一下，准备……”队长的话音未落。
突然，地上那几具看似死亡的“尸体”猛地爆裂开来！没有血肉横飞，而是炸开一团团无色无味、近乎透明的查克拉雾气，瞬间笼罩了整支小队！
“小心！有毒！”队长惊呼，但已吸入少许。
雾气迅速被雨水吸收、稀释，仿佛从未存在。
队员们立刻感到一阵轻微的眩晕和恶心，但很快症状消失。
“没事吧？”队长紧张地问。
“没事，就是有点头晕，可能查克拉消耗大了。”一名队员揉了揉太阳穴。
“我也是，好像有点累。”
那名日向族人却立刻紧张了起来，一边心中默念佛经，一边试图输出刚学会的佛法。很快，小队成员就感到舒适了不少。
他们并未在意，迅速撤离。然而几天后，这支小队成员开始出现细微的变化：情绪波动减少，对话变得简洁，执行任务时更加“高效”却缺乏变通，甚至对同伴受伤也显得有些淡漠。他们自己并未察觉，但身边的战友却感到了寒意。
类似的事件在各村频繁发生。播种者小队的核心目的并非战斗，而是如同蒲公英般散播“种子”。他们本身就是移动的污染源，死亡或受创时的爆发，才是真正的攻击。忍者们引以为傲的近身战斗、忍术轰炸，反而加速了污染的扩散。
当越来越多外出执行任务的忍者小队带着这种“冷静”和“高效”返回，并在村内继续传播时，各大忍村的高层终于骇然意识到一个绝望的事实：忍者现有的力量体系，根本无法有效对抗这种无形的瘟疫。 刀剑和忍术杀不死病毒，反而可能成为它的帮凶。
绝望之下，国贤局提供的阵法技术成为了最后的救命稻草。结合各村的超大范围封印术（如四赤阳阵的简化版、结界术），以影岩、雷影塔、水影大楼等为核心，每个村子都艰难地构筑起了一个或数个安全区。
音忍村得益于较早与国贤局合作，而木叶的日向等家族早早开发了佛法抗性，保全了村子近一半区域。雾隐凭借蛤蜊和再不斩的坚守，核心区相对完整。
而初期对国贤局方案抱有怀疑、甚至暗中抵触的云之国和土之国，此刻则付出了惨重的代价。
三代土影大野木漂浮在岩隐村上空，望着下方仅存的、被巨大岩石结界笼罩的小片区域，老脸上满是悔恨与悲凉。结界外，是曾经繁荣的岩隐村，如今挤满了神情麻木、漫无目的行走的村民，其中甚至能看到不少熟悉的忍者面孔。他们的进攻性或许不强，但那无处不在的空洞眼神，比任何敌人都令人窒息。岩隐村损失了超过七成的人口和领土，精英上忍折损严重。
四代雷影艾的怒吼也失去了往日的威力。云隐村地形开阔，更难防御。虽然雷影和他的直属部队凭借强悍的体魄和意志力抵抗了侵蚀，但普通村民和大量中下层忍者几乎全军覆没。云隐村如今更像是一座孤岛，被灰色的海洋包围，昔日的繁荣与喧嚣荡然无存。艾一拳砸在雷影办公室的墙壁上，留下深深的裂痕，却无法砸碎眼前的现实。
整个忍界，被分割成了一个孤立的“安全岛”和广袤的“感染区”。晓的部队并未强攻，只是如同牧羊人般，驱使着越来越多尼人化的民众，缓缓包围、挤压着各个安全区。
安全区内的人们，面临着痛苦的抉择：外出救援？可能被感染，甚至把危险带回来。固守待援？看着结界外的同胞渐渐失去自我，资源一天天消耗。每一天，都有小型结界因为能量耗尽或内部爆发感染而熄灭，如同风中残烛。
转机直到国贤局的“便携式净化符文板”和“清心阵盘”大规模生产完毕才出现。这些基于华夏道法、结合封印术原理的装置，虽然无法根治，但能形成小范围的临时安全区，足以让忍者小队短时间外出执行营救任务。但缺点也很明显，过分依赖符咒对天地灵气的转化，而符咒的被侵蚀速度目前也无法做到标准化。
但是，各村的忍者还是开始组成精锐突击队，佩戴阵盘，如同尖刀般刺出结界，试图接回那些尚未完全被同化的零散村民。行动异常艰难，每一次出击都伴随着风险。而更令人心悸的是，在广袤的感染区，开始出现真正的“丧失围城”的场面——大量的尼人化者，在某些残余本能的驱使或幕后引导下，开始有意识地、缓慢地向还有“生机”的安全区聚集，黑压压地围在结界外，用空洞的眼神“凝视”着内部，形成巨大的心理压力。
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