李患之召集几位中枢阁大臣提出迁都之事，一番剖析利弊之后，众人恍然大悟，于是纷纷赞成女皇的决定，此事已定，李患之又再次提出了第二项议题，便是天明帝国朝廷的改制之事。
李患之之前曾经改制过一次，将原来的朝廷中央六部制度变更，加设了更多的机构，从而使得事权更加的明确细致，可经过一年多的尝试，由于种种原由，并未像李患之当初所想的那般有明显的改变，他这一次便要更为彻底和大胆的做出改变，加快推进天明帝国现代化的进程，使其可以用最快的速度成为这个世界的超级大国。
“迁都之事既然已经定下，朕便与卿等商议第二件事情。”李患之半靠在御座宽大的软垫上，一边思索着一边缓缓说道：“之前你们都是知道的，朕改制过一次，增设了一些部门，目的是使事权更加的明确和细化，也正是那时候才成立了中枢阁，你们不就是那次入阁的吗？”
他缓缓说着，仿佛是在和邻家闲聊，丝毫看不出在商讨国家大事的意思，几位大臣也是细细聆听，不知道这位陛下又要做出什么惊人的举动。李患之顿了顿，轻叹了一口气，才又继续说道：“但是这一年多来，效果却是并不如意，朕这一向来又少在京城，很多事看来没有朕为你们做主，你们也是推行不下去的，这次朕便决意给你们做个靠山，做些更彻底的改变，让国家短期内不用再为了制度的事情浪费精力。”
艾世章听了李患之的话语，心中暗喜，他身为吏部尚书，深知这一年来政务的艰难，很多任命虽然传达下去，但是官员在行驶职权上却并不能像预想中的那样顺利，过年所积累下来的习惯和弊病，不是短短一年时间可以改变的，女皇又在外用兵，京城之内以接济军需粮饷为第一要务，不能因为这些事情坏了女皇对外的方略，故而也没有时间和精力去处理这些问题，现在女皇表示要驻京给他们做后盾，很多事情处理起来就比较得心应手了。
他偷偷看了一眼坐在不远处的施梅婵，正巧施梅婵的目光也向他望来，两人会心轻笑一下，赶紧各自掩去笑意，再次静听女皇的训话。只听李患之又再说道：“朕决意将朝廷的部门名称，官职等全部改变，亲自规划出每个部门和官员的权职，由中枢阁明诏颁布，所有不按旨意行事的一律加以惩处。
另外军事方面也要进一步改革，除了前期设立的北府军之外，中府军要更加明确的划分，并且扩建东府军，增设海军规模，新建西府军，今后真正采用五军都督府制度来管理军队，使我天明帝国的军队更具战斗力。
还有就是增设一些部门，设立专门的人才进行管辖，这些事情朕已经让内侍们整理成文牍，你们大家都看一下，看过之后我们再行商议。英婉，把朕让你准备的东西给几位大人看看。”
李患之把议题的内容徐徐道来，又让唐英婉将议题内容的文牍发放给几位大臣，众人人手一份，细细看来，只见上面一条条一段段写的分外分明，内容却是不少，众人足足看了小半个时辰才算是大概看明白了所以然。
其实内容与李患之所说的大致相同，其中首先列举了朝廷现行的所有部门名称及职能范围，其首长及副官等官职的职权，再往后便是从属官吏的名称及职责，每个部门、官职后面都用红色的朱笔御批了修改后的名称及职责，无论官职大小巨细分明，看的众人对这位女皇是一阵佩服。
上面明确写到朝廷今后的除了中枢阁为皇帝的秘书班子，负责为皇帝咨询提出建议之外，还有整理政务政令的职责，并依据皇帝的旨意，下发诏谕等工作。对全国各地上报的奏疏、战报等整理汇总，除了直接密奏皇帝的折本，其余的一律由中枢阁先行阅览，整理简明扼要的内容再上报皇帝知晓，并附带处理意见，供皇帝参考。
其次是朝廷中央设立的一级行政部门，分别为：
人事部主管人事调动、升迁任免、考绩勘核；
司法部主管全国刑法政令、审核刑名；
财政部主管全国财政；
文教部主管全国文化教育事务；
外交部主管外交事务；
内政部主管民政、行政管理；
工建部主管全国建设、工程；
商贸部主管内外商贸体系建设及法规；
国防部主管非战时军队管理、训练、整编、装备采购、后勤物资；
五军都督府主管战时战略、战术的制定，调动指挥；
除了以上这些以部府命名的部门，还设立了几个特殊机构，其中有帝国皇家银行，掌管金融、信贷、储备；
帝国学府，为全国最高学府，负责培养国家专项人才；
帝国科学院，为最高科研机构，由原来的武备局演变而来；
帝国军工局，负责制造军工武器装备；
帝国情报局，负责收集整理情报、进行隐秘行动等任务。
这些部门除了部门的名称，长官的官职称为等，所有一切均是一应俱全，就连下设的分支机构和下级部门都被李患之一一标准，可谓是一份详细的组织架构及工作职能图表。
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