本月，楚军和淮军集结于湖北境内，共计七万余人，联合围剿任柱、赖文光部捻军。郭松林军在德安受挫，总兵张树珊战死，贼军声势更盛。
陕西官军战败溃散，张总愚部逼近西安省城。乔松年抵达陕西后，紧急调令刘松山部入关增援。
曾国藩办理剿捻事务已一年有余，最初设立驻兵四镇的策略，后又制定扼守黄河、运河的方略，但都未能长久实施便有所调整。他在临淮时，搜捕蒙城、亳州一带的匪徒，以断绝捻军的根基；在徐州时，处理了湖团大案，以消除捻军的外援。刘铭传、刘松山、潘鼎新三军历经大小数十战，使捻军原本纵横驰骋、来去如风的势头确实因此有所减弱。
这年冬天，张宗禹部捻军进入陕西，任柱、赖文光部窜入湖北，中原地区才稍得喘息。然而当年朝中言官弹劾曾国藩办理军务不善的奏疏接连不断，御史朱镇、卢士杰、朱学笃等人的奏章均被抄发传阅。御史穆缉香阿上奏称曾国藩督师日久无功，请求予以惩处。朝廷下谕旨道：“一年多来，曾国藩所派将领转战山东、河南、湖北、安徽等省，不遗余力，歼灭贼寇为数不少，虽未能立即大功告成，又岂能与贻误军情者相提并论？该御史所奏，着毋庸议。钦此。”此后又有御史阿凌阿弹劾曾国藩骄横妄为等罪状，同样遭到圣旨驳斥。曾国藩深感权位所在即为众矢之的，始终戒慎恐惧不敢懈怠！
同治六年（丁卯年），曾国藩五十七岁。
正月，曾国藩驻周家口军营。
初六日，启程前往徐州。
十三日，途经砀山境内，散发二十六串铜钱赈济饥民。
十五日，抵达徐州。
十九日，正式接收两江总督印信、两淮盐政印信及通商大臣关防，与李鸿章共同筹划西北军务大局。
二十一日，曾国藩紧急上奏折，报告已返回徐州并接任总督职务的日期。附片奏报：捻军目前在湖北境内，官军已形成合围之势，但担心任柱、赖文光部可能继续流窜进入陕西，建议鲍超一军暂时留在河南西部拦截，待敌情稳定后再调往陕西。另附片奏报彭玉麟自愿捐出养廉银两，朝廷下旨要求查明其子弟情况并给予嘉奖。但彭玉麟坚决推辞，态度极为诚恳，恳请朝廷批准他的请求，以成全他报效国家的诚意。
二十九日，接到朝廷谕旨：“曾国藩既已接任两江总督，所有考察官吏、筹措军饷及地方应办事务均至关重要；且金陵重地亦需威望素着之大臣坐镇。着即返回省城驻守，以资震慑。该总督公忠体国，自当体察朝廷倚重之深恩，竭力为国效力。所有军情调度事宜，仍着李鸿章随时咨商，以收协同之效。钦此。”
本月，张锡嵘在陕西战死。
鲍超率军回师襄阳，在杨家洚大败捻军；追击至丰乐河再次大胜，歼灭敌军万余人。任柱、赖文光部捻军逃往河南境内。
李鸿章奉旨出任湖广总督，李瀚章调任江苏巡抚并暂代湖广总督，刘琨授任湖南巡抚。
二月初三日，李鸿章率军开赴河南督师，仍驻扎周家口。
初八日，曾国藩专折上奏，叩谢朝廷年终恩赏。同时奏报军需款项：自咸丰三年起至收复金陵之日止，历时十二年之久，累计用银达两千一百三十余万两。现分四案开列简明清单，依例办理报销。附片奏请：安徽抵征税银一项，按比例核销。另附片奏明江忠义、席宝田两军饷银归入江西汇总造册上报。又附片奏请补发湘军积欠饷银，列入第四案续报款项。另奏请新授江苏布政使丁日昌暂缓进京觐见。
十四日，曾国藩紧急上奏，报告已奉谕旨移驻金陵，并呈报启程日期。另奏：去年奉旨调至军营差遣的官员——道员钟文、总兵沈宏富、提督何绍彩，已分别派往各路任职。附片奏请道员祝垲仍应交由李鸿章随营差遣。又附片奏请甘肃道员金国琛开缺回乡奉养父母。另附片奏请对阵亡编修张锡嵘之子施恩抚恤。同时奏请在周家口为阵亡总兵张树珊建立专祠。另奏报彭玉麟水师营与鲍超霆军查办闹事官兵的情况。
十六日，曾国藩从徐州启程，在韩庄换乘船只，沿途巡视运河堤防工程。
二十二日，抵达清江浦，张之万前来拜见。
二十三日，吴廷栋在船上谒见曾国藩，随后乘船随同前往金陵。
二十六日，曾国藩视察清水潭堤防工程。
三十日，抵达扬州。
本月，任柱、赖文光率领的捻军向东流窜进入安徽境内，随后又折返湖北东部，湘军遭遇挫败，彭毓橘在黄州战死。
刘松山率军进入陕西，连续击败张宗禹部捻军。
三月初一日，曾国藩与官文在船上会面。
初二日，曾国藩视察瓜洲盐栈。
初六日，曾国藩抵达金陵，返回总督衙门。金陵百姓在道路两旁焚香迎接。
初十日，他巡视了新修缮的江宁学宫工程。
十五日，刘琨乘船经过金陵时前来拜见。
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