第2天，刘协在上庸太守府的大堂上举行了一次小型朝会，当众颁下圣旨，封申耽为上庸太守，封申仪为南阳太守，并令申仪即刻到新野赴任。
同时，他也对申耽说了庞统教给他的那一套说辞，让申耽陪着申仪一起赴任。
听了刘协的话，申氏兄弟的表情很复杂。但没有办法，他们只得回去准备了。
刘协接下来开始安排政务。他连续做出了以下决定：
1、令关羽分兵去接收上庸下属的几个县，并全权处理各县的事务。县里如有兵马，全部收编；原有的官员，量才留用，不能用的就撤换；
2、派出使者返回江夏报信，请糜竺安排匠作营搬迁的事。同时，要求使者在经过襄阳时，把攻取上庸的消息告知刘表；
3、另派出一个使者，乘快艇前往新野，赶在申氏兄弟的前面进城，一面召石韬来上庸，以待重新安排官职；一面警告刘封，要他当心申氏兄弟；
4、令诸葛亮暂代上庸太守一职，以统计上庸的兵马、钱粮、人民、土地；
5、令刘备接洽城内的耆老，以了解上庸的政务得失。
下午，有人向刘协回报：申仪在哥哥申耽的陪同下，带着家人、十几个亲信出发了。
还真跟刘协预计的一样。
半路上，申氏兄弟一合计：
如今这个小皇帝，手里只有几千兵马，肯定成不了气候。一旦曹操亲自领兵来攻，他必然兵败被擒。咱们兄弟跟着他，断然没有什么前途。干脆，咱们一不做二不休，到新野后杀了忠于刘协的官员，献了城池投降曹操算了。咱们俩本来就是曹操的臣子，又献了新野，使曹丞相全取了南阳郡，一定能得到他的重用。跟着曹丞相，总好过跟着刘协朝不保夕的。
这两个人打定了主意，半路里卸下一个亲信，给了他许多金银，令他潜回上庸，好接申耽的家人出来。
然后，兄弟二人继续乘船前往新野，作计要献了新野，投降曹操。
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说回刘协，申氏兄弟走了之后，刘协命关羽整编上庸的守军。
这一调查不要紧，好家伙！军中的大小校尉，一多半都姓申！这要是直接全盘接收，岂能不出事？
就连见多识广的关羽也感到后怕！
他将上庸的大部分兵马遣散，只留了少数战力较强、且与申氏兄弟关联不大的人。800来个降兵，最终只收编了200余人。
同时，刘协协助诸葛亮对上庸的政务进行了整顿，遣散了部分官员，又任命了部分官员。太守府衙里当差的人里面，姓申的也不少！
吉邈抵达上庸后，刘协给他调拨了500兵卒，连同接收的降兵，合计700多人，令吉氏兄弟镇守上庸，不再随军西征。
在后续的作战中，上庸将成为粮草、兵员的调度中转站，这些也都将成为吉邈的职责。
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刘协在上庸住到月底，他和他的臣子们逐渐理清了上庸的方方面面。
所有的属县也已经全部收服，建立了正常的统治秩序。
石韬也已经来到了上庸。刘协让他跟诸葛亮进行交接，将由他暂代上庸的太守职权。不过，他并没有给石韬明确的官职。
原因很简单：他还正等着他刚封的上庸太守申耽叛变呢！
左等，他不叛变；右等，他还不叛变，刘协也等得焦急呀！
一个天天盼着臣属叛变的皇帝，整个历史上应该也不多吧？
其实，还是他心急了，毕竟上庸到新野，光路上也得好几天走呢！
二月初，刘协的大军继续西进，兵锋直指汉中的张鲁。
还没走到汉中的地界，刘协就收到了吉邈的一份急报：申耽突然派人接走了自己的家人，浮江东去了。
由于事情做得非常机密，等吉邈察觉，他们已经走了有三天了。
刘协明白：申氏兄弟真的叛变了。
果然，又过了一天，刘封派人送来急报：申仪在上任仅仅五天后，盗取了府库里的金银细软，与申耽及一众亲信叛逃到宛城去了。刘封派人去追，被东里衮派人阻拦，没有追上。
原来，申氏兄弟到了新野之后，打算先联络东里衮，再设计杀了刘封，然后献城投降。
结果到了新野之后，他们才明白：刘协只是让他当一个太守，只有管民的权力，没有管兵的权力。新野的兵马，全部掌握在刘封手里。
然后，他们兄弟又打算杀害刘封，以夺取新野的兵权。
但刘封的警惕性很高，一直住在军营里，周围始终有健壮的兵卒保护，使他们一直找不到机会。这是当然了，刘协已经派人警告过刘封了嘛！
同时，他们发现新野的守军对刘协、刘备的忠诚度很高，即使杀了刘封，他们依然无法获得新野的兵权，反而有可能丧命。
两兄弟一商量，他们不能再等了，因为申耽的家人已经被接出来了，再晚就会惊动刘协，想跑也跑不了了。
于是，二人与一众亲信将新野府库里的钱财盗出，趁夜逃离新野，走水路去投靠东里衮了。
刘协收到消息后，反而长长地出了一口气，悬着的心终于是落了下来。
物以类聚，人以群分。三观不合的人，合作起来也是一种痛苦，将来也一定会闹掰的。如今他们主动跑了，自己也省了很多麻烦事。
他当即写了一道圣旨，正式册封石韬为上庸太守。同时，他还让石韬选派一个人暂代新野令。
而庞统听说申氏兄弟叛逃后，专门跑过来，用了许多肉麻的话夸刘协，说他神机妙算，料敌于先，识人断物之能无人可比，天下万民有福了，云云。
夸完了，他又问刘协：“不知陛下可否调查过张鲁，他是否也会投降呢？”
刘协道：“张鲁自称天师，常用妖术迷惑百姓，朕不能容他，他也不会降于朕。朕觉得他一定会坚决抵抗的。”
果然，刘协的话又一次应验了。
快要进入汉中的地界时，先锋关羽派人来报：“前方的郧关内，有1500名敌军驻守，拒不投降。他的前锋部队没有攻城器械，因此无法破关，不得不在关前扎下营寨，请求中军支援。”
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