在名为“新生之城”的洁白都市，疾病如同被遗忘的古老词汇。城市的核心，是如同巨大神经中枢的“生命之树”生物科技集团。莉亚安·索恩博士是“生命之树”基因治疗部的明星科学家，她冷静、精准，如同她操纵的 CRISPR 仪器。然而，这座完美城市的光辉，却照不进她内心的角落——她四岁的儿子，埃利奥斯。
埃利奥斯出生时携带一种极其罕见的基因缺陷——“威廉姆斯-科恩综合征”，这导致他神经发育异常，表现为严重的感官失调、沟通障碍和脆弱的免疫系统。在“新生之城”，这种“不完美”近乎一种原罪。莉亚安无法接受自己的儿子成为统计学上的瑕疵，成为旁人怜悯或回避的对象。她的爱，混合了顶尖科学家的骄傲、深沉的愧疚（她总隐约觉得是自己的工作环境导致了基因突变），以及一种近乎偏执的掌控欲，化作一个秘密计划。
她动用了最高权限，在绝对保密的私人实验室里，为埃利奥斯量身定制了一套基因“修补剂”。这不是普通的药物，而是纳米级别的基因编辑载体，伪装成睡前服用的营养滴剂。疗程是漫长的，需要持续数年，悄无声息地改写他DNA链条上那些“错误”的片段。
“埃利，喝了这个，你会变得强壮，像其他孩子一样奔跑玩耍。”每晚，莉亚安都会用温柔却不容置疑的语气，将几滴无色无味的液体滴入儿子的牛奶。埃利奥斯睁着大而迷茫的眼睛，顺从地喝下。他无法理解复杂的基因工程，只知道妈妈在帮他，妈妈的眼神里有一种他渴望回应的、灼热的光。
变化是缓慢而显着的。埃利奥斯的身体逐渐强壮，不再轻易生病。他刺耳的尖叫减少了，开始能发出一些模糊的音节，甚至对莉亚安的触摸不再表现出剧烈的抗拒。学校的评估报告也一次比一次乐观。莉亚安欣喜若狂，认为自己的决定无比正确，是科学和母爱的伟大胜利。她小心翼翼地销毁所有实验痕迹，沉浸在“治愈”成功的喜悦中。
然而，就在埃利奥斯五岁生日过后不久，怪事开始发生。
一个午后，埃利奥斯在玩积木时，突然毫无征兆地停下动作，小小的身体剧烈颤抖起来，眼神空洞地望着空中某一点，发出一种非哭非笑的、介于呜咽和咯咯声之间的怪异声响。莉亚安冲过去抱住他，却发现他体温偏低，皮肤泛起一种不健康的鸡皮疙瘩。几分钟后，发作停止，埃利奥斯像虚脱一样瘫软在她怀里，对刚才的事毫无记忆。
莉亚安起初以为是治疗过程中的神经调整反应。但类似的情况越来越频繁。埃利奥斯开始出现更诡异的症状：他会突然对某些从未见过的地方表现出极大的恐惧（比如储藏室阴暗的角落），或是对一些普通的气味（如某种消毒水或茉莉花香）产生强烈的呕吐反应。更让她毛骨悚然的是，有时在深夜，她会听到埃利奥斯在睡梦中用一种完全陌生的、带着哭腔的童稚声音，断断续续地重复几个词：“……黑……挤……妈妈……痛……”
莉亚安的专业知识让她无法再将这些归咎于简单的后遗症。她秘密调取了埃利奥斯的脑波活动和基因表达谱进行深度分析。结果让她如坠冰窟。
在埃利奥斯的大脑神经元网络中，检测到了一些极其微弱、但与他自身脑波频率迥异的信号碎片。这些信号碎片携带的信息，支离破碎，却指向同一个来源——它们不属于埃利奥斯。而基因比对更显示，这些外来神经印记的基因序列，与埃利奥斯有高度同源性，但却存在着……早期胚胎发育阶段的特征。
一个可怕的念头如同闪电般击中了莉亚安。在埃利奥斯之前，她曾有过两次意外流产，都在孕早期。当时忙于事业顶峰的她，并未过多悲伤，甚至有种隐秘的解脱。难道……难道是基因修补剂在编辑埃利奥斯基因的同时，某种尚不可知的副作用，打通了某种……基于基因共鸣的、与未出生同胞的……连接？埃利奥斯正在被动地读取那些从未有机会见天日的胚胎留下的、混沌而痛苦的“记忆碎片”？
这个想法如此荒诞，却又完美地解释了所有症状。那些莫名的恐惧，对应的是胚胎在冰冷器械操作下的终止过程？那些呕吐反应，是针对流产时可能使用的麻醉或消毒药剂？那些梦呓，是尚未形成意识的细胞团，在消亡瞬间留下的、对“存在”和“母亲”最原始的、充满痛苦的烙印？
莉亚安几乎崩溃。她试图停止给药，但为时已晚。基因编辑是不可逆的。更可怕的是，停止“修补剂”后，埃利奥斯的情况急剧恶化。他不仅原有的感官失调症状反弹，那些“外来记忆”的侵袭反而变本加厉，仿佛失去了“修补剂”某种程度的“稳定”作用，那些胚胎的怨念碎片更加汹涌地试图占据这具它们唯一能接触到的、血脉相连的身体。
埃利奥斯变得时而狂躁，时而呆滞。他有时会长时间地蜷缩在衣柜最底层，模仿子宫内的姿势；有时会对着空气喃喃自语，仿佛在与看不见的“朋友”分享玩具；有时又会突然攻击莉亚安，用指甲抓挠她，哭喊着“为什么不要我！”，那声音混合了他自己的童声和另一种更尖细、更扭曲的声线。
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